研究报告/Research Report

中华鳖 5 个群体遗传多样性的微卫星分析  

刘阳1,2 , 史燕1 , 朱新平1,2 , 赵建1 , 周贵谭3 , 洪孝友1
1中国水产科学研究院珠江水产研究所, 农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室, 广州, 510380;
2 上海海洋大学水产与生命学 院, 上海, 201306;
3 广东绿卡实业有限公司, 东莞, 523912
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2012 年, 第 1卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2012年10月28日    接受日期: 2012年10月29日    发表日期: 2012年10月30日
© 2012 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》2012 年,第31 卷,第2 期,第141-146 页上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

Liu Y., Shi Y., Zhu X.P., Zhao J., Zhou G.T., and Hong X.Y., 2012, Genetic diversity in five populations of Trionyx sinensis revealed by microsatellite markers, Jiyin Zuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 31(2): 141-146 (刘阳, 史燕, 朱新平, 赵建, 周贵谭, 洪孝友, 2012, 中华鳖5个群体遗传多样性的微卫星分析, 基因组学与应用生物学, 31(2): 141-146)

摘 要

利用微卫星分子标记技术对洞庭(DT)、黄河(HH)、黄沙(HS)、日本(RB)以及洞庭(DT)与黄河(HH)的 杂交子代(DT♀×HH♂)绿卡(LK) 5 个中华鳖群体的 150 个个体进行遗传多样性分析。11 对微卫星引物扩增 出的等位基因数为 3~6 个,平均等位基因数为 4.181 8。5 个种群相比,绿卡(LK)的平均有效等位基因数、平 均期望杂合度、平均观测杂合度和平均多态信息含量最高,分别是 2.396 9、0.527 4、0.554 5 和 0.466 0。对种群间的遗传分化分析表明,黄河(HH)和洞庭(DT)之间的遗传分化最小,为 0.023 3,而洞庭(DT)和日本(RB)之 间的遗传分化最大,为 0.096 9。基于 Nei's 遗传距离构建的 UPGMA 系统进化树显示黄河(HH)和洞庭(DT)及 其子代绿卡(LK)亲缘关系较近,而与黄沙(HS)和日本(RB)的亲缘关系较远,最远的为日本(RB)群体。

关键词
中华鳖;微卫星;遗传多样性;种群分化
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计算分子生物学
• 第 1 卷
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