2 贵州省农业生物技术重点实验室, 贵阳, 550006;
3 贵州省生物技术研究所, 贵阳, 550006;
4 贵州省农业科学院, 贵 阳, 550006
作者 通讯作者
计算分子生物学, 2013 年, 第 2卷, 第 8 篇
收稿日期: 2013年08月24日 接受日期: 2013年08月24日 发表日期: 2013年08月25日
Li X.X., Tan Y.M., Liu Y.X., and Liu Z.Y., 2013, Cloning and sequence analysis of the full length YchF cDNA in Aspergillus chevalieri var. intermedius, Jiyin Zuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 32(2): 185-189 (李孝霞, 谭玉梅, 刘永翔, 刘作易, 2013, 谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因cDNA全长克隆及序列分析, 32(2): 185-189)
从谢瓦氏曲霉间型变种抑制性差减杂交(SSH)文库中,筛选到一个子囊孢子时期差异表达的序列标签A0128.860,以其序列为模板设计特异性引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆获得了该基因的全长cDNA,命名为eYchF。生物信息学分析显示,该基因包含一个1 182 bp的完整开放阅读框(ORF),编码393个氨基酸,相对分子质量为43.466 9 kD,预测的理论等电点为6.99,包括一个保守的G domain(guanine nucleotide-binding domain)和一个TGS(ThrRS, GTPase, SpoT) domain,为疏水蛋白。序列同源性分析表明:该基因与棒曲霉(Aspergillus clavatus NRRL 1)的GTP结合蛋白YchF相似度为84%,谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因的克隆及生物信息学分析为YchF的进一步研究奠定了基础。