曹德民¹ , 张穗生² , 罗贞贞¹ , 黄日波^1,2

1广西大学生命科学与技术学院, 南宁, 530003;
2广西科学院广西生物炼制重点实验室, 非粮生物质酶解国家重点实验室, 国家非粮生物质能 源工程技术研究中心, 南宁, 530007
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2014 年, 第 3卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2014年09月13日    接受日期: 2014年10月20日    发表日期: 2014年10月12日

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推荐引用：

Cao D.M., Zhang S.S., Luo Z.Z., and Huang R.B., 2014, Development of a method to sequence a wild-type industrial strain of Saccharomyces cerevisea with Miseq, Jiyin Zuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 33(3): 655-660 (曹德民, 张穗生, 罗贞贞, 黄日波, 2014, 野生型工业酿酒酵母Miseq测序方法的建立, 基因组学与应用生物学, 33(3): 655-660)

新一代测序方法在基因组学研究应用日趋广泛，已经成为工业酿酒酵母菌株基因组学研究的重要技术平台，但对工业酿酒酵母新一代测序技术方法缺乏详细报道。Miseq是小型新一代基因组测序仪，本文报道我们自建的野生型工业酿酒酵母基因组Miseq测序方法。该方法包括：制备分离a型和α型交配型的单倍体菌株、采用电泳和分光光度法方法监控基因组文库建立、优化上机文库浓度后测序。其中电泳和分光光度法方法为首创的文库质量监控简易方法，质控检测得到酿酒酵母工业菌株测序条件为：菌株的基因组文库DNA片段大小为250~850 bp且主要集中在350~550 bp，文库浓度范围为7~13 ng/μL；上机测序文库的优化浓度为20 pM。

酿酒酵母；野生型工业菌株；Miseq；基因组测序方法；文库质量