研究报告

毛竹NAC转录因子家族生物信息学分析  

黎帮勇 , 胡尚连 , 曹颖 , 徐刚
西南科技大学植物细胞工程实验室, 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心, 绵阳, 321010
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2015年05月20日    接受日期: 2015年05月20日    发表日期: 2015年05月20日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》印刷版2015年,第34卷,第08期上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):

黎帮勇, 胡尚连, 曹颖, 徐刚, 2015, 毛竹NAC转录因子家族生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 34(8): 1769-1777

引用格式(英文):

Li B.Y., Hu S.L., Cao Y., and Xu G., 2015, Bioinformatics Analysis of NAC Gene Family in Moso Bamboo, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 34(8): 1769-1777

摘 要

NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物对非生物胁迫、激素信号应答以及器官形成中发挥重要作用。到目前为止,毛竹NAC转录因子很少被研究,为进一步研究毛竹NAC转录因子家族,本文利用生物信息学方法,对125条毛竹NAC蛋白序列的系统发生、氨基酸组成、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析。系统进化树分析结果表明,125条毛竹NAC蛋白被划分为17个亚族,毛竹NAC结构域中包含8个保守的NAM基序,主要分布在N端的。不同亚族的毛竹NAC蛋白在氨基酸数目以及氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异,二级结构主要由随机卷曲构成,α-螺旋和β-转角在所有毛竹NAC蛋白中均有分布, 且在各亚族中没有明显的差异。 125条毛竹NAC蛋白的三级结构绝大部分相似。本研究结果为毛竹NAC基因家族功能的进一步研究提供了理论依据。

关键词
毛竹;NAC基因家族;生物信息学
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计算分子生物学
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