常凯 , 熊怡淞 , 曲远青 , 陈清红 , 吴艾霖 , 吴丽娟

中国人民解放军成都军区总医院实验医学中心高湿医学全军重点实验室, 成都, 610083
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2015年08月20日    接受日期: 2015年08月20日    发表日期: 2015年08月20日

本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》印刷版2015年，第34卷，第09期上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

引用格式(中文)：

常凯, 熊怡淞, 曲远青, 吴艾霖, 陈清红, 吴丽娟, 2015, 基于生物信息学方法的FOX基因家族对比分析, 34(9): 1818-1825

引用格式(英文)：

Chang K., Xiong Y.S., Qu Y.Q., Wu A.L., Chen Q.H., and Wu L.J., 2015, Comparative Analysis of FOX Family Genes Based on the Bioinformatics Methods, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 34(9): 1818-1825

以FOXA，FOXO和FOXP为核心，利用生物信息学方法对比分析FOX家族成员的分子特征、启动子、蛋白理化性质、蛋白结构、亚细胞定位，构建分析蛋白三维模型并绘制家族系统进化树。结果表明：FOX家族的核酸序列相似性较低，FOXP和FOXN序列内含较多内含子，但仍具有溯源性。蛋白的脂肪族氨基酸指数介于49.71到76.11，分子量介于29084到79586.1，较为离散。GRAVY值介于-0.764到-0.179，蛋白均表现为亲水性。pI值在亚家族间非常稳定，可作为蛋白分类的辅助指标。对比统计FOX蛋白高级结构各亚家族的保守结构域和功能位点，可见功能域的差异导致了其调节途径的多样。分析结果可为FOX蛋白的研究提供有价值信息，为进一步研究FOX在人体内的疾病发生途径与作用机理提供依据。

叉头框基因家族；生物信息学；对比分析；分子特征；蛋白特征