引用格式(中文)：

Swain, 2014, 基于多个模板进行in-silico分析预测菠菜(Spinacia olearacea)光系统Ⅱ的D2蛋白的最佳模型, 计算分子生物学(online), 3(7): 1-6 (doi: 10.5376/cmb.cn.2014.03.0007)

引用格式(英文)：

Swain, 2014, In-silico analysis predicting the best model for photosystemIID2 Protein of Spinacia olearacea using multiple templates, Computational Molecular Biology (online), 3(7): 1-6 (doi: 10.5376/cmb.cn.2014.03.0007)

菠菜（Spinacia olearacea）是一种天然的抗糖尿病、前列腺癌、哮喘、便秘、高血压的药物。菠菜具有抗炎、抗增殖、抗氧化的作用。在这项研究中的考虑用in-silico分析光系统Ⅱ的D2蛋白。使用1IZLD，3A0B，3WU2，4IL6模板生成D2蛋白的模型。从UniProt检索序列，通过blastp工具预测模板，使用prot-param工具分析蛋白质的理化性质，使用CFFSP服务器进行二级结构预测，分析其螺旋、旋转和折叠，使用modeller 9.12工具生成同源模型，使用Rampage服务器进行骨架确认，最后利用3A0B模板建立最好的模型。3A0B模板与Thermosynechocuccus vulcanus光系统Q (B)蛋白有91%的疑似覆盖率，即有94.0%残基落在允许区内，2.0%的残基落在非允许区，以及有95%的序列同一性。