1动物遗传学系, 农学部, Bu-Ali Sina University, 哈马丹, 伊朗
2动物遗传学系, 伊朗农业生物技术研究所, 雷什特, 伊朗
3动物遗传学系, 农学部, University of Guilan, 雷什特, 伊朗
作者 通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 7 篇 doi: 10.5376/cmb.cn.2015.04.0007
收稿日期: 2015年09月07日 接受日期: 2015年09月07日 发表日期: 2015年09月07日
2动物遗传学系, 伊朗农业生物技术研究所, 雷什特, 伊朗
3动物遗传学系, 农学部, University of Guilan, 雷什特, 伊朗
作者 通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 7 篇 doi: 10.5376/cmb.cn.2015.04.0007
收稿日期: 2015年09月07日 接受日期: 2015年09月07日 发表日期: 2015年09月07日
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本文首次以英文发表在 Computational Molecular Biology 2015, Vol. 5, No. 1, 1-13上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License 协议对其进行授权,用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如果读者对中文含义理解有歧义,请以英文原文为准。
推荐引用:
Talebi et al., 2015, In Silico investigation for hemoglobin characterizations leads to new aspects in susceptibility to glycosylation, Computational Molecular Biology, Vol.5, No.1, 1-13 (doi: 10.5376/cmb.2015.05.0001)
摘 要
应用In silico分析不同物种的血红蛋白表征特别是糖基化的抗性。多重序列比对结果显示骆驼、人类、牛和马中都具有L-K-V-K-E-G-E-A-L-R-P-T-F-F-D-L-S-A-V-K-H-G-K-V-H-D-L-S-L-H-K-L-V-D-P-N-F-L-L-L-A-F-T-P-A-K-V-L-Y的2个血红蛋白亚基序列。血红蛋白序列在进化过程中和不同物种之间是非常保守的。双峰驼家庭HBA存在于相同的群体(91% bootstrapping),然而HBB在同一个群体(95% bootstrapping)。骆驼血红蛋白似乎比其他物种更加基础。基于等电点,骆驼HBB在电泳中具有高于HBA的迁移率。骆驼中血红蛋白的带电荷和亲水性氨基酸比人类多。葡萄糖与蛋白质或HbA1c的非酶结合被揭示,人类中的两个亚基血红蛋白都具有对N-糖基化的抗性,但骆驼HBB仅对O-糖基化具有抗性。此外,HBB在骆驼中具有关键作用,例如对糖基化和之后糖尿病的抗性。
关键词
In silico;多重比对;血红蛋白;糖基化;HbA1c