评述与展望/Review and Progress

CDRH:人类复杂疾病相关单倍体数据库  

Ruijie Zhang , Yongshuai Jiang , Hongchao Lv , Xuehong Zhang , Peng Sun , Yan Zhang , Jin Li , Mingming Zhang , Zhenwei Shang , Xia Li
哈尔滨医科大学, 生物信息科学与技术学院, 哈尔滨, 150086
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2012 年, 第 1卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2012年12月01日    接受日期: 2012年12月01日    发表日期: 2012年12月02日
© 2012 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次以英文发表在 Computational Molecular Biology上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License 协议对其进行授权,用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如果读者对中文含义理解有歧义,请以英文原文为准。
推荐引用:

Zhang et al., 2011, CDRH: A Database of Complex Disease-related Haplotypes in Human, Computational Molecular Biology, Vol.1, No.3 12-19 (doi: 10.5376/cmb.2011.01.001)

摘 要

许多常见DNA序列及其特定组合(单倍体)的变异可能是导致个体对复杂疾病的易感性差异的根本原因。在积累大量与复杂疾病相关的单倍体资源方面取得了巨大进展。然而,这些资源分散在不同的文献中,导致信息的利用率降低。因此,我们开发了人类复杂疾病相关单倍体数据库(CDRH)。到目前为止,已经从274篇论文中手动提取了总共1 125个单倍体,涉及到114种复杂疾病如乳腺癌,2型糖尿病和类风湿性关节炎。经仔细阅读文献后,我们获得了关于单倍体和疾病的详细信息。此外,我们整合了来自外部数据库的基因和SNP(和/或微卫星)的相关信息,以促进进一步分析。通过一个用户容易掌握的界面,用户可以通过疾病名称,基因名称,染色体数或SNP IDrs#)查询CDRH。我们希望CDRH将丰富我们的单倍体知识,并促进单倍体与可遗传的复杂疾病风险之间的关系的研究。CDRH数据库可从http://bioinfo.hrbmu.edu.cn/cdrh免费获取。

关键词
CDRH;单倍型;复杂疾病
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计算分子生物学
• 第 1 卷
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