Suchitra , Kiran D. , Jitendra K. , Samiran , Jayasankar

鱼类遗传与生物技术部, ICAR-中央淡水水产养殖研究所, 布巴内斯瓦尔, 奥里萨邦, 751002,印度
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 8 篇   doi: 10.5376/cmb.cn.2015.04.0008
收稿日期: 2015年09月07日    接受日期: 2015年09月07日    发表日期: 2015年09月07日

本文首次以英文发表在 Computational Molecular Biology 2015, Vol. 5, No. 3, 1-9上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License 协议对其进行授权，用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如果读者对中文含义理解有歧义，请以英文原文为准。

推荐引用：

Kumari et al., 2015, Comparative Study of Cellular Tumor Antigen p53 Protein of Fishes and Analysis of its Protein Interaction Network using Computational Approach, Computational Molecular Biology, Vol.5, No.3, 1-9 (doi: 10.5376/cmb.2015.05.0003)

生物信息学领域的进展已经促进了解全球基因网络及其蛋白质产品。在本研究中，使用生物信息学工具进行9种鱼的细胞肿瘤抗原p53蛋白的比较分析。细胞肿瘤抗原p53作为肿瘤抑制基因，在细胞凋亡和基因组稳定性中起作用。本研究的结果表明，大多数物理化学性质在Q92143（Xiphophorus maculates）和O57538（Xiphophorus helleri）中几乎相同。为了了解全球网络的细胞肿瘤抗原p53，我们使用STRING 9.1工具，并推测这种蛋白质与几个其他蛋白质相互作用，但功能节点-CHEK1，BCL2，MDM4在斑马鱼、青鳉和红木瓜狗头中具有高置信分数。强关联相互作用见于mdm2和p53之间，在Danio rerio中具有良好的高分。我们还研究了细胞肿瘤抗原p53和斑马鱼Mdm2之间的分子对接。此外，我们调查了存在于所有九个不同的蛋白质序列中的保守区域，尽管物质已形成，但该区域仍由进化保持。本研究将进一步支持了解鱼中各种细胞途径的作用和相关蛋白。这项工作也有用于研究p53蛋白的结构和功能分析。

细胞肿瘤抗原p53；序列分析；蛋白质相互作用网络；保守区；生物信息学；理化性质；Mdm2