Hongbo Liu¹ , Zhe Li² , Jing Ding³ , Jie Liu³ , Yan Zhang¹

1哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院, 哈尔滨, 150081;
2哈尔滨医科大学药学院, 哈尔滨, 150081;
3哈尔滨医科大学第二附属医院, 哈尔滨, 150081
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2013 年, 第 2卷, 第 10 篇   doi: 10.5376/cmb.cn.2013.02.0010
收稿日期: 2013年10月08日    接受日期: 2013年10月16日    发表日期: 2013年10月23日

本文首次以英文发表在 Computational Molecular Biology上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License 协议对其进行授权，用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如果读者对中文含义理解有歧义，请以英文原文为准。

推荐引用：

Liu et al., 2013, Identification of the Bona fide Differentially Methylated Gene Markers among Cancers, Computational Molecular Biology, Vol.3, No.2 6-15 (doi: 10.5376/cmb.2013.03.0002)

DNA甲基化在肿瘤的发展中起着重要的作用。以前的研究已经确定了癌症和正常对照组之间甲基化位点(DMS)的差异，但是，甲基化在多发性癌症中的变异并没有被发现。在这项研究中，我们检测了6例癌症(C-DMSs)和5例正常对照组(T-DMSs)中的DMSs，结果显示C-DMSs与T-DMSs高度重叠。剔除T-DMSs后，挑选4159 C-DMSs用于研究多发性癌症中的甲基化变异。进一步的分析证实了C-DMSs在癌症相关基因差异表达中的调节作用，此外，发现这些与C-DMSs相关的基因在生物学过程中会富集，如细胞膜的形成、细胞粘附、细胞迁移、免疫应答和细胞增殖以及在肿瘤和膀胱癌路径中。参与肿瘤的发生的hsa-mir-323针对28个基因，最后，我们通过提取蛋白质交互网络确定了潜在的癌症相关基因，为挖掘潜在的癌症特异性甲基化标志物和癌基因提供了一个新的框架。

DNA甲基化；C-DMSs；甲基化变异；肿瘤特异性甲基化标记