Sagar S. Patel¹ , Dipti B. Shah¹ , Hetalkumar J. Panchal²

1. G. H. Patel Post Graduate Department of Computer Science and Technology, Sardar Patel University, Vallabh Vidyanagar, Gujarat-388120, India
2. Gujarat Agricultural Biotechnology Institute, Navsari Agricultural University, Surat, Gujarat- 395007, India
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2014 年, 第 3卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2014年12月24日    接受日期: 2014年12月24日    发表日期: 2014年12月25日

本文首次以英文发表在 Computational Molecular Biology上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License 协议对其进行授权，用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如果读者对中文含义理解有歧义，请以英文原文为准。

推荐引用：

Patel et al., 2014, Comparative study of five Legume species based on De Novo Sequence Assembly and Annotation, Computational Molecular Biology, Vol.4, No.9, 1-6 (doi: 10.5376/cmb.2014.04.0009)

豆科植物是世界热带和亚热带地区的一种重要的油料作物。最近，名为RNA-seq的新一代测序技术为转录组分析提供了强有力的方法。这项研究是集中在RNA序列对五种豆科植物，分别是来自NCBI数据库的花生SRR1212866、鹰嘴豆SRR627764、菜豆SRR1283084、葫芦巴SRR066197和豌豆SRR403901。比较研究侧重于各种重要特征如：用N50，序列组装重叠群产生reads，用已知的蛋白质和基因进一步搜索; 其中，许多基因是根据GO功能分类注释并通过搜索KEGG数据库将序列定位到途径中。这些数据将用于基因发现和功能研究，并且在当前研究中报道的大量转录物将作为这五种豆科物种的有价值的遗传资源。

De Novo组装；生物信息学；豆科植物；序列组合和注释