1 International Burch University, Genetics and Bioengineering Department, Francuske Revolucije bb, Ilidža, 71000 Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
2 Department of Clinical Pathology, Clinical Center of the University of Sarajevo, Bolnicka 25, 71000 Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
作者 通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 9 篇 doi: 10.5376/cmb.cn.2015.04.0009
收稿日期: 2015年10月07日 接受日期: 2015年10月07日 发表日期: 2015年10月07日
2 Department of Clinical Pathology, Clinical Center of the University of Sarajevo, Bolnicka 25, 71000 Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
作者 通讯作者
计算分子生物学, 2015 年, 第 4卷, 第 9 篇 doi: 10.5376/cmb.cn.2015.04.0009
收稿日期: 2015年10月07日 接受日期: 2015年10月07日 发表日期: 2015年10月07日
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本文首次以英文发表在 Computational Molecular Biology 2015, Vol. 5, No. 4, 1-8上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License 协议对其进行授权,用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如果读者对中文含义理解有歧义,请以英文原文为准。
推荐引用:
DOGAN S., and Kurtovic-Kozaric A., 2015, Changes of Molecular, Cellular and Biological Activities According to microRNA-mRNA Interactions in Ovarian Cancer, Computational Molecular Biology, 5(4): 1-8 (doi: 10.5376/cmb.2015.05.0004)
摘 要
microRNA是非编码RNA序列,20-22个核苷酸长,其在沉默基因表达中起作用。正常microRNA表达的变化可致癌。本研究阐明了卵巢癌中microRNA的表达与正常表达相比的变化,这样比较可以更好地理解卵巢癌发生。在肿瘤样品中,在680种microRNA类型中230种显示高表达,295种显示低表达,155种为非表达。当我们基于倍数增加>50分类microRNA时,我们发现microRNA有31高表达和89低表达。异常表达的巨大差异显示microRNA活性的变化程度。使用Cancerminer工具我们发现了这些异常表达microRNAs的相应的mRNA目标。我们发现,由数据过程捕获的最多的靶基因与细胞增殖和癌发生有关。
关键词
卵巢癌;TCGA;REC得分;Cancerminer
计算分子生物学
• 第 4 卷