上海交通大学, 生命科学技术学院, 上海, 200240
作者 通讯作者
癌症与分子诊断研究, 2020 年, 第 9 卷, 第 2 篇
收稿日期: 2020年03月06日 接受日期: 2020年03月29日 发表日期: 2020年05月05日
作者 通讯作者
癌症与分子诊断研究, 2020 年, 第 9 卷, 第 2 篇
收稿日期: 2020年03月06日 接受日期: 2020年03月29日 发表日期: 2020年05月05日
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推荐引用:
引用格式(中文):
朱良全, 常亚飞, 李婧, 2020, HBV相关肝癌组织中微生物宏蛋白质组特征分析, 癌症与分子诊断研究(online) Vol.9 No.1 pp.11-19 (doi: 10.5376/cmdr.cn.2020.09.0002)
引用格式(英文):
Zhu L.Q., Chang Y.F., and Li J., 2020, Identification of metaproteomics characterization of HBV-related hepatocellular carcinoma, Aizheng Yu Fenzi Zhenduan Yanjiu (online) (Cancer and Molecular Diagnosis Research) Vol.9 No.1 pp.11-19 (doi: 10.5376/cmdr.cn.2020.09.0002)
摘要
越来越多的证据表明微生物菌群和肝脏疾病有着密切联系,但是HBV相关肝细胞癌(hepatitis B virus (HBV)-related hepatocellular carcinoma, HCC)人群肝脏组织内的微生物菌群种类和数量仍不清楚。本研究中,我们对来自165个HCC人群的肝癌组织和对应癌旁组织的质谱数据进行宏蛋白质组学层面的鉴定。结果显示,在肝癌组织中,绿弯菌门(Chloroflexi),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),黄单胞菌目(Xanthomonadales),军团菌目(Legionellales),颤藻目(Oscillatoriales)等微生物菌群数量出现显著上调。结合COG(Clusters of Orthologous Groups)数据库对鉴定到的蛋白质进行注释,我们还发现了许多在肝癌组织中高表达的微生物功能分类。对比健康人群的肝脏组织的宏蛋白质组鉴定结果,我们发现在HCC人群的肝脏组织中,变形菌门(Proteobacteria)的含量降低,厚壁菌门(Firmicutes)的含量升高。我们认为这项研究可以对肝脏微生物菌群的失调与HCC发生之间的研究提供更多启发。
关键词
乙肝病毒; 微生物; 宏蛋白质组学
(The advance publishing of the abstract of this manuscript does not mean final published, the end result whether or not published will depend on the comments of peer reviewers and decision of our editorial board.)
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