黎建辉^1,2 , 张洁^1,2 , 蔡仁祥^1,2

1浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所, 诸暨, 311800;
2诸暨市翠溪生物技术研究院, 诸暨, 311800
作者    通讯作者
基因组学与生物技术, 2020 年, 第 9卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2020年03月03日    接受日期: 2020年04月08日    发表日期: 2020年04月12日

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青稞是西藏人的主食，青稞在青藏高原上种植约有3 500年的历史，禾本科大麦属的一个变种---裸大麦(Hordeum vulgare Linn. var. nudum)。和其它大麦不同，青稞在青藏高原长达3 500~4 000年的驯化栽培，已经完全适应了极端的高原气候。研究人员对西藏地方品种“拉萨钩芒”进行了全基因组测序及图谱绘制，获得了大小为3.89 Gb的基因图谱，共包含36 151个蛋白编码基因；美国六棱啤酒大麦Morex全基因组测序获得大小为4.79 Gb的基因组数据，共识别出83 105个推定的基因位点。将Morex的基因组绘制到“拉萨钩芒”基因组中，覆盖率为92.89%；通过与Morex基因组26159个置信度较高的基因集进行比较，虽然青稞中这些基因与大麦基因存在极大地相似性，但青稞中约有10.97%的基因体长度明显长于Morex。研究人员进一步将青稞基因组和其它的禾本科作物基因组进行了比对，结果发现青稞约于1 700万年前从粗山羊草(Ae. Tauschii)，乌拉尔图小麦(T.urartu)以及普通小麦(T. aestivum)中分离出来。研究人员进一步分析发现，现代青稞基因组中仍然有大量的序列同Ae. Tauschii、T.urartu和T. aestivum相似，其相似基因家族数目高达18 849个。从基因组数据看，青稞还是大麦家族的一员吗？值得进一步商榷。

青稞；大麦；基因组