广东养殖尼罗罗非鱼 3 个不同群体 MHC ⅡB 基因序列多态性和遗传分化 
庞纪彩12 
,
高风英1 ,
卢迈新1 
,
赵金良2 ,
朱华平1 ,
可小丽1 ,
刘志刚1
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高风英1 ,
卢迈新1 ,
赵金良2 ,
朱华平1 ,
可小丽1 ,
刘志刚1
1 中国水产科学研究院珠江水产研究所, 广州, 510380;
2 上海海洋大学水产与生命学院, 上海, 201306
作者 通讯作者
海洋生物学学报, 2014 年, 第 3卷, 第 3 篇
收稿日期: 2013年11月04日 接受日期: 2013年12月24日 发表日期: 2014年04月14日
2 上海海洋大学水产与生命学院, 上海, 201306
作者 通讯作者
海洋生物学学报, 2014 年, 第 3卷, 第 3 篇
收稿日期: 2013年11月04日 接受日期: 2013年12月24日 发表日期: 2014年04月14日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》2014年第33卷上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用：
引用格式(中文)：
卢迈新等, 2015, 微胶囊饲料对马氏珠母贝生长性状和矿化基因表达的影响, 基因组学与应用生物学(online) Vol.4 No.34 (doi: 10.5376/jmb.cn. 2014.03.0003)
引用格式(英文)：
Lu et al., 2015,The Influences of Simulated Typhoon to Two Kinds of Oxidative Stress Genes' Expression of Pinctad amartensii, Jiyin Zuxue yu Yingyong Shengwuxue (online) (Genomics and Applied Biology) Vol.4No.34(doi: 10.5376/jmb.cn. 2014.04.0003)
摘 要
利用一对特异性引物 MHC 2b-snp-sf 和 MHC 2b-snp-sr，从广东省 3 个不同罗非鱼养殖地区(以下分别称高要群体, 茂名群体, 惠州群体)采集的 137 尾尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus, GIFT strain)的个体基因组中扩增出长度为 775~796 bp 的片段。 克隆后测序，序列分析结果显示：775~796 bp 的核苷酸序列中共检测出 62 个简约信息位点，49 个单碱基突变位点。112 个多态位点中，增添 / 缺失位点 34 个，转换位点 44 个，颠换位点 33 个，另外一个位点既出现转换(C/T)又出现颠换(A/T)。137 尾个体的 751 个阳性克隆的测序结果分析表明，751 条序列分属于 4 个等位基因。其中，等位基因 Orni-DAB*0101 在 3 个群体中所占比例最高(85.2%)。等位基因的分布及群体内遗传多样性参数分析表明：高要、 茂名群体遗传多样性较丰富，惠州群体遗传多样性较低。群体间的分化指数(FST 值)、 平均基因流(Nm)、 分子方差分析(AMOVA)和平均 K 2-P 遗传距离均表明 3 个养殖群体间存在广泛的基因交流，未发生群体间的遗传分化。 该研究结果提供了广东地区养殖尼罗罗非鱼 MHC ⅡB 基因的部分遗传信息，为尼罗罗非鱼抗病品系的选育提供理论依据。
关键词
尼罗罗非鱼；主要组织相容性复合体(MHC)； 多态性；遗传分化
