史卫东¹ , 黄如葵¹ , 王益奎¹ , 周建辉¹ , 赵坤¹ , 李秋雯²

1广西农科院蔬菜研究所, 南宁, 530007; 2广西农业职业技术学院, 南宁, 530007
作者    通讯作者
植物药与药理学杂志, 2012 年, 第 1卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2012年10月05日    接受日期: 2012年10月18日    发表日期: 2012年10月28日

本文首次发表在 《基因组学与生物应用学》2012年31卷第5期上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

引用格式(中文)：

史卫东等, 2012, 利用MSAP分析18个芥蓝齐口期的表观遗传多样性, 植物药与药理学杂志(online) Vol.1 No.6 pp.1-4 (doi:10.3969/gab.031.000505 )

引用格式(英文)：

Shi et al., 2012, The epigenetic genetic diversity of 18 Chinese kales analyzed by MSAP when initiated flowering, Zhiwuyao Yu Yaolixue Zazhi (online) Vol.1 No.6, pp.1-7 (doi: 10.3969/gab.031.000505)

 

芥蓝(Brassica oleracea L.var.alboglabra Bailey)是起源于我国南方的著名特产蔬菜之一。本研究利用MSAP检测18个芥蓝齐口期DNA甲基化水平，分析了表观遗传多样性，探讨DNA甲基化模式对齐口期的影响。分析表明，18个芥蓝齐口期平均为50天，叶片数平均为10片，齐口期和叶片数不相关(相关系数为0.296)；变异系数分别为21%和18%；遗传距离分布在0~40，平均值为12.2276，在10.62处分为3类。MSAP分析表明，5对引物组合扩增得到432条多态性条带，201条片段表现出多态性，多态性比率为47%；Nei遗传距离分布在0.004~0.467，平均值为0.0958，表明遗传多样性水平较低；在0.04处分为3类。Mantel测验表明两种分析的遗传距离相关系数为-0.1366，显示齐口期、叶片数与DNA甲基化多态性没有相关性。DNA甲基化模式分析表明，非甲基化片段为110条，甲基化多态性片段为322条，分为3种带型，类型一为非甲基化带型(110条)，类型二为甲基化带型(110条)，类型三为半甲基化带型(152条)，非甲基化片段和半甲基化片段在不同品种之间呈现多态性，甲基化片段在不同品种之间呈现多态性与单态性相差不大，显示MSAP多态性主要来源于非甲基化和半甲基化片段，芥蓝甲基化模式以半甲基化为主。本文推测芥蓝DNA甲基化水平降低与在齐口期调控有关，MSAP分析用于结构基因组研究，还可以用于功能基因组研究。

芥蓝；表观遗传多样性； MSAP分析