普通油茶泛素结合酶(E2S)的蛋白质结构分析  

林萍1 , 姚小华1 , 王开良1 , 曹永庆1 , 滕建华2
1. 中国林科院亚热带林业研究所, 富阳, 311400
2. 浙江省金华市婺城区东方红林场, 金华, 321025
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 51 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0051
收稿日期: 2012年09月05日    接受日期: 2012年10月19日    发表日期: 2012年11月17日
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引用格式(中文):
林萍等, 2012, 普通油茶泛素结合酶(E2S)的蛋白质结构分析, 分子植物育种(online) Vol.10 No.51 pp.1376-1382(doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0051)
引用格式(英文):
Lin et al., 2012, Characterization of Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2S from Camellia Oleifera, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.51 pp.1376-1382 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0051)
 

摘 要

泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中三个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。本研究采用Solexa测序技术获得了一条油茶E2的全长cDNA序列,命名为UBE2S,该基因编码270AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性,UBE2S蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第13~145位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第79~127位氨基酸残基区域中有21个残基与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中94位的半胱氨酸残基是活性位点,有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2S具有C端延伸结构,所以在普通油茶E2基因家族中属于Ⅱ类E2。

关键词
普通油茶;泛素结合酶;solexa测序;生物信息学
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《分子植物育种》网络版
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