菠菜性别相关EST-SSR标记的开发及应用  

邓传良 , 高俊 , 曹莹 , 秦瑞云 , 高武军 , 卢龙斗
河南师范大学生命科学学院, 新乡, 453007
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 48 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0048
收稿日期: 2012年06月07日    接受日期: 2012年08月21日    发表日期: 2012年11月05日
© 2012 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》(2012年第31卷第5期467-472页)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):
邓传良等, 2012, 菠菜性别相关EST-SSR标记的开发及应用, 分子植物育种(online) Vol.10 No.48 pp.1354-1359 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0048)
引用格式(英文):
Deng et al., 2012, Development and Application of Sex-specific EST-SSR Marker in Spinach (Spinacia oleracea L.), Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.48 pp.1354-1359 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0048)
 

摘 要

为了明确菠菜EST序列中SSR的总体特点,开发菠菜EST-SSR引物;为利用EST-SSR引物进行菠菜性别相关特异序列的克隆奠定基础,本文从NCBI上获得1 093条EST,并利用在线软件SSRIT检测所含SSR序列,并进行分析。共检索出68条SSR序列,分布于64条EST中,检出率为6.22%,包括22种重复基元。其中二核苷酸重复基元的EST-SSR占主导地位,占总SSR数目的32.3%。利用在线引物设计软件Primer 3.0设计了7对EST-SSR引物,在适合的PCR反应体系下,分别以雌、雄菠菜DNA基因组为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,结果显示以EST序列HS097148设计的一对引物从菠菜雌雄基因组中扩增出一条雄性特异的条带,表明通过菠菜EST-SSR引物获得菠菜性别相关特异序列是可行的。

关键词
菠菜; 表达序列标签;微卫星
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《分子植物育种》网络版
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