利用MSAP分析18个芥蓝齐口期的表观遗传多样性  

史卫东 , 黄如葵 , 陈振东 , 罗海玲 , 康红卫 , 梁家作 , 刘杏连
广西农科院蔬菜研究所, 南宁, 530007
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 47 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0047
收稿日期: 2011年12月12日    接受日期: 2012年08月21日    发表日期: 2012年11月05日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》(2012年第31卷第5期505-512页)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):
史卫东等, 2012, 利用MSAP分析18个芥蓝齐口期的表观遗传多样性, 分子植物育种(online) Vol.10 No.47 pp.1346-1353 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0047)
引用格式(英文):
Shi et al., 2012, The Epigenetic Genetic Diversity of 18 Chinese Kales Analyzed by MSAP when Initiated Flowering, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.47 pp.1346-1353 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0047)

摘 要

本研究利用MSAP检测18个芥蓝齐口期DNA甲基化水平,分析了表观遗传多样性,探讨DNA甲基化模式对齐口期的影响。结果表明,18个芥蓝齐口期平均为50 d,叶片数平均为10片,齐口期和叶片数不相关(相关系数为0.296);变异系数分别为21%和18%;遗传距离分布在0~40,平均值为12.227 6,在10.62处分为3类。MSAP分析表明,5对引物组合扩增得到432条多态性条带,201条片段表现出多态性,多态性比率为47%;Nei遗传距离分布在0.004~0.467,平均值为0.095 8,表明遗传多样性水平较低;在0.04处分为3类。Mantel测验表明两种分析的遗传距离相关系数为-0.136 6 ,显示齐口期、叶片数与DNA甲基化多态性没有相关性。DNA甲基化模式分析表明,非甲基化片段为110条,甲基化多态性片段为322条,分为3种带型,类型一为非甲基化带型(110条),类型二为甲基化带型(110条),类型三为半甲基化带型(152条),非甲基化片段和半甲基化片段在不同品种之间呈现多态性,甲基化片段在不同品种之间呈现多态性与单态性相差不大,显示MSAP多态性主要来源于非甲基化和半甲基化片段,芥蓝甲基化模式以半甲基化为主。本文推测芥蓝DNA甲基化水平降低与在齐口期调控有关,MSAP分析用于结构基因组研究,还可以用于功能基因组研究。

关键词
芥蓝;表观遗传多样性;MSAP分析
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《分子植物育种》网络版
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