富含多糖的野生西瓜果实RNA提取方法研究  

刘景安1,2 , 郭绍贵2 , 张海英2 , 任毅2 , 宫国义2 , 许勇2
1. 中国农业科学院蔬菜花卉研究所, 北京, 100081
2. 国家蔬菜工程技术研究中心, 北京, 100097
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2013 年, 第 11卷, 第 3 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0003
收稿日期: 2012年11月30日    接受日期: 2012年12月17日    发表日期: 2013年04月16日
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引用格式(中文):
刘景安等, 2013, 富含多糖的野生西瓜果实RNA提取方法研究, 分子植物育种(online), 11(3): 1014-1018 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0003)
引用格式(英文):
Liu et al., 2013, Study on the Methods of Total RNA Extraction from Wild Type Watermelon Fruit with Rich Polysaccharides, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding), 11(3): 1014-1018 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0003)

摘 要

野生西瓜果实富含多糖类物质,果实组织高质量RNA提取困难。为解决这一问题,我们把SDS法、改良CTAB法和改良LiCl沉淀法等三种常规RNA提取方法与本研究提出的改良SDS法对野生西瓜PI296341-FR (Citrullus lanatus subsp. Lanatus)果肉RNA提取效果进行了比较和分析。结果表明只有改良SDS法能够在保证RNA质量和产率的同时有效去除多糖。与常规SDS法相比,改良SDS法增加了醋酸钾缓冲液(5 mol, pH 6.0)和无水乙醇(1/4体积)共同沉淀多糖的步骤,但醋酸钾缓冲液用量仅需1/100体积。改良SDS法提取的总RNA完整性、纯度和产率较为理想,28S rRNA和18S rRNA条带清晰,无降解;OD260nm/OD280nm比值为1.97,OD260nm/OD230nm比值为1.91;RNA提取产率为15~20 μg/g•FW,可满足后续分子生物学实验的要求。

关键词
野生西瓜;多糖;RNA提取;改良SDS法
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《分子植物育种》网络版
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