甘蓝型油菜BnPPR636及其启动子的克隆与表达分析  

彭鹏飞1 , 胡琼1 , 李云昌1 , 刘道敏2 , 付丽1 , 张洪1 , 梅德圣1
1. 中国农业科学院油料作物研究所国家油料作物改良中心,农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室, 武汉, 430062
2. 安徽省六安市农业科学研究所, 六安, 237400
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 68 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0068
收稿日期: 2012年07月18日    接受日期: 2012年08月02日    发表日期: 2012年12月19日
© 2012 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次发表在 《分子植物育种》(2012年第10卷第6期693-700页)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):
彭鹏飞等, 2012, 甘蓝型油菜BnPPR636及其启动子的克隆与表达分析, 分子植物育种(online) Vol.10 No.68 pp.1497-1504 (doi: 10.5376/mpb.cn. 2012.10.0068)
引用格式(英文):
Peng et al., 2012, Cloning and Expression Analysis of BnPPR636 and Its Promoter in Rapeseed (Brassica napus), Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.68 pp.1497-1504 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0068)
 

摘 要

PPR蛋白对植物的生长发育、逆境抗性以及育性具有重要的调节作用。本研究根据氨基酸序列的保守性,利用CODEHOP方法,通过简并引物扩增甘蓝型油菜基因组DNA,得到PPR基因片段。结合RACE技术,在甘蓝型油菜品系120中扩增得到了PPR基因cDNA的全长序列。分析发现该PPR基因编码一个含636个氨基酸的蛋白质,具有11个PPR基序,不含有内含子,具有典型的PPR基因特征,命名为BnPPR636。Blast比对发现,BnPPR636与白菜P2克隆的一个未知蛋白的氨基酸序列一致性最高,达到75%。RT-PCR分析表明,BnPPR636在花中的表达量最高,在根与角果中的表达量次之,叶和茎中较低。进化树分析表明,BnPPR636蛋白与其他植物中和CMS育性恢复有关的PPR蛋白序列的一致性较高。以基因组DNA为模板,利用染色体步移技术,得到了BnPPR636基因起始密码子上游1 145 bp的DNA片段。经生物信息学软件分析表明,该序列具有典型的启动子序列特征,并含有许多相关的顺式作用元件,可能参与调节花和根的发育。

关键词
油菜病;同源克隆;同源克隆;CODEHOP;RACE;染色体步移
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《分子植物育种》网络版
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