柽柳EST-SSRs标记开发与群体检测 
张如华 
,
李锐 ,
赵景奎 ,
徐立安 
,
李锐 ,
赵景奎 ,
徐立安
南京林业大学, 林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室, 南京, 21003
作者 通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 38 篇 doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0038
收稿日期: 2010年11月18日 接受日期: 2011年02月28日 发表日期: 2011年04月02日
作者 通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 38 篇 doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0038
收稿日期: 2010年11月18日 接受日期: 2011年02月28日 发表日期: 2011年04月02日
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推荐引用：
张如华等, 2011, 柽柳EST-SSRs标记开发与群体检测, 分子植物育种 Vol.9 No.38 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0038)
摘 要
本研究通过对从NCBI获得的柽柳属植物的22 712条EST序列进行拼接，共得到9 439条Unigene 。我们从中发掘出分布于202条精确型基序中的206个EST-SSR位点，SSR发生频率为2.14%，平均分布距离为54.99 kb。在柽柳属植物EST-SSR中，二核苷酸和三核苷酸重复是主要的重复类型，分别占33.01%和40.29%。AT/TA、AG/TC和AAT/TTA是二核苷酸、三核苷酸的优势重复类型。利用PRIMER5.0软件设计引物164对，随机挑选75对引物进行合成，发现40对引物能较好扩增条带，其中具有多态性引物14对，多态比率为35%。通过变性聚丙烯酰胺凝胶结合银染的方法对6个柽柳天然群体进行了遗传多样性检测，构建了聚类分析树状图。研究结果表明，从柽柳属植物EST中开发柽柳SSR标记是有效、可行的，本研究所开发的EST-SSR引物可用于柽柳遗传分析研究。
关键词
EST-SSR标记；柽柳属植物；柽柳；群体检测
