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《分子植物育种》网络版, 2013 年, 第 11卷, 第 11 篇 doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0011
收稿日期: 2013年04月21日 接受日期: 2013年04月23日 发表日期: 2013年05月22日
引用格式(中文):
张秀荣等, 2013, 花生Cu/Zn-SOD基因(AhCSD1)克隆及品种间等位多态性分析, 分子植物育种(online), 11(11): 1068-1081 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0011)
引用格式(英文):
Zhang et al., 2013, Cloning and Allelic Polymorphism Analysis of Cu/Zn-SOD Gene (AhCSD1) in Peanut (Arachis hypogaea L.), Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding), 11(11): 1068-1081 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0011)
为明确花生Cu/Zn-SOD基因(AhCSD1)结构及不同基因型种质间遗传多态性,本研究利用同源克隆技术从花生栽培种和花生区组二倍体野生种中获得AhCSD1,并进行生物信息学分析。山花9号AhCSD1序列分析结果表明,两条cDNA序列 rShCSD1-1和rShCSD1-2同源性98.18%,编码区存在10个SNP;对应核DNA序列gShCSD1-1与gShCSD1-2同源性97.08%,共存在64个差异位点,其中27个SNP,两条序列具有3个限制性酶识别位点的差异;两条序列均含有8个外显子和7个内含子。4个栽培品种的rCSD1-2与gCSD1-2序列分别一致;rCSD1-1与gCSD1-1序列同源性分别为99.68%和99.70%;编码区存在6个SNP,引起对应氨基酸序列的第53、第75、第147位残基变异。与野生种序列比对结果显示山花9号gShCSD1-2与B组A.ipaensis的gAipCSD1同源性100%,gShCSD1-1与A组A.duranensis和A.kuhlmannii的gAduCSD1和gAkuCSD1同源性分别为99.89%和99.48%;分子进化分析结果表明gCSD1-1与gCSD1-2分别来自栽培种的A、B两个染色体组;A.ipaensis为栽培种花生B染色体组供体;A.duranensis和栽培种花生的亲缘关系比A.kuhlmannii更近。研究结果为揭示AhCSD1基因结构差异、转录水平与抗旱性的相关性,明确不同花生品种的抗旱机制提供重要参考。