Ipomoea trifida(2X)谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)基因克隆与序列分析  

张安 , 曹清河 , 赵冬兰 , 周志林 , 唐君
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所, 农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室, 徐州, 221131
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2013 年, 第 11卷, 第 12 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0012
收稿日期: 2013年05月05日    接受日期: 2013年05月07日    发表日期: 2013年05月23日
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推荐引用:

张安等, 2013, 三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida)(2X)谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)基因的克隆与生物信息学分析, 分子植物育种(online), 11(12): 1082-1088 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0012)
引用格式(英文):
Zhang et al., 2013, Cloning and Bioinformatical Analysis of Glutathione Peroxidase from Ipomoea trifida (2X), Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding), 11(12): 1082-1088 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0012)

摘 要

为了研究三浅裂野牵牛抗逆相关基因,根据转录组拼接结果设计特异引物,进行RT-PCR扩增,首次获得了三浅裂野牵牛谷胱甘肽过氧化物酶编码区序列,并进行生物信息学分析。经测序发现,此序列包含510 bp的完整开放阅读框,软件预测可以编码169个氨基酸残基的多肽,预测多肽分子量大小约为18.7 kDa,等电点为6.32,在GenBank中登录,登录号是KC961953,并命名为ItGPX。ItGPX有大段亲水区,推测在细胞核中起到抗氧化作用。系统发育分析表明ItGPX和甘薯IbGPX最为接近,使用PSIPRED和3D-JIGSAW分别预测了ItGPX的二级和三级结构。三浅裂野牵牛谷胱甘肽过氧化物酶基因的克隆为甘薯抗逆育种提供了新的基因资源。

关键词
甘薯;谷胱甘肽过氧化物酶;Ipomoea trifida;基因克隆;序列分析
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