研究报告/Research Report

香青菜亚麻酸含量性状相关miRNA的鉴定  

王镇1 , 刘照坤2 , 杜奕承1 , 陈素娟1 , 陈国元1
1苏州农业职业技术学院, 苏州, 215008
2苏州市农业科学院, 苏州, 215008
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2020年06月01日    接受日期: 2020年06月04日    发表日期: 2020年06月11日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次发表在 分子植物育种((ISSN1672-416X,CN46-1068/S))上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:
王镇, 刘照坤, 杜奕承, 陈素娟, 陈国元, 2020, 香青菜亚麻酸含量性状相关miRNA 的鉴定, 分子植物育种(网络版), 18(9): 1-8 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0009) (Wang Z., Liu Z.K., Du Y.C., Chen S.J., and Chen G.Y., 2020, Identification of miRNA associated with linolenic acid content traits in Xiangqingcai, Fengzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 18(9): 1-8 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0009))
摘 要

本研究旨在发掘香青菜(Brassica campestris ssp.chinensis L. Makino, NHCC)中影响亚麻酸含量的相关miRNA及其对应靶基因,探究他们的调控机制。以香青菜亚麻酸含量差异大的两个亚种‘绣花筋’和‘黑叶香青菜’的成熟叶片为材料,采用小RNA高通量测序来鉴定两个材料中差异表达的miRNA且预测其靶基因,并进行基因功能注释。试验共鉴定得到miRNA 236个,包括159个已知miRNA,77个新的miRNA。筛选出差异表达的miRNA63个,其中,以‘黑叶香青菜’为对照,上调的有28个,下调的35个。差异表达的miRNA对应的靶基因中共6 041个得到功能注释,其涉及的主要通路多个与脂肪酸代谢相关,如“α-亚麻酸代谢”、“脂肪酸合成”、“不饱和脂肪酸的生物合成”、“脂肪酸降解”等。差异表达miRNA的靶基因主要是一些亚麻酸合成或代谢重点的关键酶,如脂氧合酶(lipoxygenase, LOX)、3-酮酰基-CoA硫酶2 (3-ketoacyl-CoA thiolase, KCS)等。香青菜通过对这些miRNA在不同品种中的差异表达负调控LOX等脂肪酸代谢关键基因和KCS等亚麻酸合成相关基因的表达,从而一方面减少亚麻酸的代谢损失,另一方面增加亚麻酸的合成量,从而引起亚麻酸含量的增高。

关键词
香青菜;亚麻酸;差异表达miRNA;miRNA靶基因
[全文 HTML]
    0.625
00120
《分子植物育种》网络版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
王镇
.
刘照坤
.
杜奕承
.
陈素娟
.
陈国元
相关论文
.
香青菜
.
亚麻酸
.
差异表达miRNA
.
miRNA靶基因
服务
. 发表评论