李谋亮 , 张晓妮 , 林胜男 , 吴全淑 , 包满珠 , 傅小鹏

华中农业大学园艺林学学院, 园艺植物生物学教育部重点实验室, 武汉, 430070
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 33 篇   
收稿日期: 2020年09月01日    接受日期: 2020年09月04日

本文首次发表在 分子植物育种（(ISSN1672-416X，CN46-1068/S)）上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

李谋亮, 张晓妮, 林胜男, 吴全淑, 包满珠, 傅小鹏, 2020, 月季R2R3-MYB转录因子全基因组鉴定与分析, 分子植物育种(网络版), 18(33): 1-11 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0033) (Li M.L., Zhang X.N., Lin S.N., Wu Q.S., Bao M.Z., and Fu X.P., 2020, Genome-wide identification and expression analysis of the R2R3-MYB genes family in Rosa chinensis, Fengzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 18(33): 1-11 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0033))

月季是世界著名的观赏植物，具有极高的观赏价值和经济价值。本研究基于月季基因组利用生物信息学对月季R2R3-MYB基因家族进行全面鉴定，并对这些基因的结构、保守域和组织特异表达进行研究，解析月季R2R3-MYB转录因子在月季发育过程中的生物学功能。根据已报道的拟南芥R2R3-MYB基因，利用本地BLAST以及Hmmer工具鉴定月季基因组(Rosa chinensis ‘Old blush’)中的R2R3-MYB基因，共鉴定出120个月季R2R3-MYB家族基因。系统进化树分析表明，月季R2R3-MYB家族基因可被分为34个亚组；其家族成员氨基酸序列N端均含有2个不等重复结构域R2和R3；基因结构分析显示，月季R2R3-MYB家族基因含有1~11个外显子；染色体定位发现120个基因分别定位在月季的7条染色体上，并发生8次串联重复事件；通过对基因组相关性分析共发现16对重复基因的R2R3-MYB基因簇。基因表达模式分析表明，120个基因在月季发育中均有表达，根据表达聚类分析可分为6个亚组，每个亚组之间存在表达差异。

月季；R2R3-MYB家族；生物信息学；表达模式