胡阳阳 , 孙琳琳 , 王多祥 , 张大兵 , 蔡文国

上海交通大学生命科学技术学院, 上海, 200240
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 34 篇   
收稿日期: 2020年09月01日    接受日期: 2020年09月04日    发表日期: 2020年09月04日

本文首次发表在 分子植物育种（(ISSN1672-416X，CN46-1068/S)）上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

胡阳阳, 孙琳琳, 王多祥, 张大兵, 蔡文国, 2020, 水稻NRL基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析, 分子植物育种(网络版), 18(34): 1-12 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0034) (Hu Y.Y., Sun L.L., Wang D.X., Zhang D.B., and Cai W.G., 2020, Genome-wide identification and bioinformatics analysis of NRL gene family in rice, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 18(34): 1-12 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0034))

NRL (NPH3/RPT2-Like)基因家族是植物中特异存在的基因家族，根据拟南芥NRL基因家族中参与植物向光性响应的NPH3 (NONPHOTOTROPIC HYPOCOTYL3)和RPT2 (ROOT PHOTOTROPISM2)命名。本研究利用生物信息学方法鉴定到27个水稻NRL基因，分布在除10号染色体外的染色体上，同时基因复制分析结果表明，全基因复制或片段复制比串联复制在水稻NRL基因家族扩张中起更大的作用。利用单、双子叶植物的七个物种进行的系统进化关系分析，将192个NRL基因家族成员分为6个不同的组。水稻NRL家族的结构特征分析显示，多数成员含有NRL基因家族的特征结构域，而基于RNA-Seq和微阵列数据的表达分析结果表明，水稻NRL家族基因在多个组织表达，同时部分基因在叶片、花序和花药中高表达。本研究对水稻NRL基因家族进行鉴定和分析，为进一步研究水稻NRL基因家族的功能提供了一定的参考和依据。

水稻；NRL；基因家族；生物信息学