中国林业科学研究院, 经济林研究开发中心, 国家林业和草原局泡桐研究开发中心, 经济林种质创新与利用国家林业和草原局重点实验室, 郑州, 450003
作者 通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 38 篇
收稿日期: 2020年09月07日 接受日期: 2020年09月10日
作者 通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 38 篇
收稿日期: 2020年09月07日 接受日期: 2020年09月10日
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本文首次发表在 分子植物育种((ISSN1672-416X,CN46-1068/S))上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:
陈晨, 徐宛玉, 朱高浦, 赵罕, 刘慧敏, 王淋, 乌云塔娜, 20XX, 西伯利亚杏开花相关基因的转录组测序分析, 分子植物育种(online), 18(38): 1(10.5376/mpb.cn.2020.18.0038)
摘 要
为探明调控西伯利亚杏(Prunus sibirica)成花的分子机制,筛选参与调控开花的相关候选基因,本研究以两个不同时期的西伯利亚杏花芽为样本进行转录组测序,共获得42.04 Gb高质量数据,平均95.6%的数据均可以比对上参考基因组。共筛选出6 850个显著差异表达基因,其中在花芽萌动期上调表达基因有2 784个,下调表达基因4 066个,花芽萌动期特异表达基因392个,盛花期特异表达基因346个。KEGG富集结果表明差异表达基因在植物激素信号转导、苯丙素生物合成、淀粉和蔗糖代谢等代谢通路被富集最多。另外,本研究共发现39个显著差异表达基因涉及植物开花调控的相关途径,主要包括:春花途径相关基因中10个、光周期途径相关基因17个、自主途径相关基因5个、霉素途径相关基因1个、温度途径相关基因2个,整合因子(SOC1, FT, LFY)共4个。研究结果可为西伯利亚杏开花调控提供了重要的候选基因,对西伯利亚杏育种具有一定的参考价值。
关键词
西伯利亚杏;开花调控;差异表达基因;转录组
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