姚运法 , 洪建基 , 赖正锋 , 林碧珍 , 练冬梅

福建省农业科学院, 亚热带农业研究所, 漳州, 363005
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 40 篇   
收稿日期: 2020年09月21日    接受日期: 2020年09月23日    发表日期: 2020年09月23日

本文首次发表在 《分子植物育种》(ISSN1672-416X，CN46-1068/S)上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

赖正锋, 姚运法, 林碧珍, 练冬梅, 洪建基, 2020, 低温胁迫对冰菜转录组响应分析, 分子植物育种(网络版), 18(40): 1-11 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0040) (Lai Z.F., Yao Y.F., Lian D.M., Lin B.Z., and Hong J.J., 2020, Analysis of transcriptome response to low temperature stress in Mesembryanthemum crystallinum Linn., Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 18(40): 1-11 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0040))

利用二代高通量测序技术对低温胁迫处理冰菜测序，构建冰菜转录组数据库。分别得到24.13 Gb有效数据和24 045条Unigene的注释，得到DEGs 1 902个(T0 vs T1)和2 134个(T0 vs T2)。(T0 vs T1)组和(T0 vs T2)组分别有40和41个功能小类化归GO数据库；分别有20个和24个功能分类注释到KOG数据库；155和272条基因得到注释到KEGG数据库，并分别富集在74和105条代谢通路。(T0 vs T1)组DEGs主要注释到植物信号转导等4个代谢通路；(T0 vs T2)组DEGs注释到苯丙醇类生物合成等11代谢通路，其中正向影响代谢途径：丙酮醇类生物合成、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、脂肪酸代谢、类黄铜代谢、氨基酸的生物合成代谢途径等；负向影响代谢途径：植物-病原互作、植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等途径。通过对其中淀粉和蔗糖代谢途径关键基因分析表明：低温胁迫1 h (T1)，海藻糖6-磷酸合酶、海藻糖-6-磷酸酯酶、β-淀粉酶、葡萄糖-1-磷酸腺苷酰转移酶、糖原磷酸化酶等5个关键基因表现为上调表达，未见下调表达基因；低温胁迫36 h (T2)，海藻糖-6-磷酸合酶、己糖激酶、β-淀粉酶等3个关键基因上调表达，葡萄糖内酯-1,3-β-葡萄糖苷酶基因下调表达。选取淀粉和蔗糖代谢途径中8个DEGs，经qRT-PCR分析，8个DEGs的相对表达量与转录组表达水平相符。

冰菜；转录组； 差异表达基因；淀粉和蔗糖代谢

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