安霞¹ , 朱强¹ , 楼旭平² , 李鲁峰² , 陈杰³ , 柳婷婷¹ , 李文略¹ , 骆霞虹¹ , 朱关林¹ , 余利隽¹

1浙江省萧山棉麻研究所, 浙江省园林植物与花卉研究所, 杭州, 311251
2杭州市萧山区农业科学技术研究所, 杭州, 311202
3华中农业大学, 武汉, 430070
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 46 篇   
收稿日期: 2020年10月27日    接受日期: 2020年10月27日    发表日期: 2020年11月03日

本文首次发表在 《分子植物育种》(ISSN1672-416X，CN46-1068/S)上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

安霞, 朱强, 楼旭平, 李鲁峰, 陈杰, 柳婷婷, 李文略, 骆霞虹, 朱关林, 余利隽, 2020, 洋桔梗(Eustoma grandiflorum)干旱胁迫转录组初步分析, 分子植物育种(网络版), 18(46): 1-7 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0046) (An X., Zhu Q., Lou X.P., Li L.F., Chen J., Liu T.T., Li W.L., Luo X.H., Zhu G.L., and Yu L.J., 2020, Transcriptome profiling of Lisianthus (Eustoma grandiflorum) under drought stress, Fengzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 18(46): 1-7 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0046))

洋桔梗(Eustoma grandiflorum)是一种原产于北美的重要观赏植物。目前为止，关于洋桔梗的基础分子研究报道数量相对较少，特别是响应干旱胁迫的分子机制相关研究。本实验利用转录组二代测序技术对干旱胁迫下的洋桔梗幼苗进行了研究。结果表明，该转录组测序数据具有良好的质量控制结果。为了在此基础上获得基因信息，利用Trinity和Corset等软件将序列进行了拼接，共得到102 014条非冗余基因，其中包含2 929条编码基因，经分析发现分属于79个转录因子家族。对所有基因进行注释，发现比对相似度最高的物种是中果咖啡。最后，对基因序列进行简单序列重复(Simple Sequence Repeat, SSR)分析，获得了所有非冗余基因以及转录因子编码基因所包含的SSR信息。本研究结果可为后续针对洋桔梗响应干旱胁迫的相关研究提供候选分子资源。

洋桔梗；干旱胁迫；转录组