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《分子植物育种》网络版, 2020 年, 第 18卷, 第 48 篇
收稿日期: 2020年11月03日 接受日期: 2020年11月03日 发表日期: 2020年11月10日
黄瑶, 李贺, 包博闻, 黄兰, 黄佳妮, 范宇畅, 2020, 沙棘苹果酸代谢关键基因ME的克隆与生物信息学分析, 分子植物育种(网络版), 18(48): 1-7 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0047) (Huang Y., Li H., Bao B.W., Huang L., Huang J.N., and Fan Y.C., 2020, Cloning and bioinformatics analysis of key gene ME in Malic Acid Metabolism of sea buckthorn, Fengzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 18(48): 1-7 (doi: 10.5376/mpb.cn.2020.18.0047))
苹果酸酶(ME)参与苹果酸的降解,是植物苹果酸代谢的关键酶。本研究根据前期的沙棘转录组测序数据设计特异性引物,利用RT-PCR技术克隆ME基因(包括NAD-ME、NADP-ME)并进行生物信息学分析。结果表明,沙棘NAD-ME基因的完整开放阅读框长1 902 bp,编码一个由634个氨基酸组成的亲水性蛋白,主要由α-螺旋(44.16%)、无规则卷曲(39.91%)和少量β-折叠(15.93%)构成,与枣的NAD-ME同源性最高。NADP-ME的完整开放阅读框长1926 bp,编码一个642个氨基酸组成的亲水性蛋白,主要由α-螺旋(37.07%)、无规则卷曲(45.64%)和少量β-折叠(15.29%)构成,与川桑和核桃NADP-ME的同源性较高。研究结果为探索沙棘苹果酸代谢的分子调控机制奠定理论基础。