研究报告/Research Report

基于全基因组重测序鉴定四株金针菇线粒体序列差异  

吕晓萌 , 王祥锋 , 张大伟 , 王庆佶 , 王威
山东农业大学植物保护学院, 山东省农业微生物重点实验室, 泰安, 271018
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2021 年, 第 19卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2021年05月12日    接受日期: 2021年05月12日    发表日期: 2021年05月12日
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本文首次发表在 《分子植物育种》(ISSN1672-416X,CN46-1068/S)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:
吕晓萌, 王祥锋, 张大伟, 王庆佶, 王威, 2021, 基于全基因组重测序鉴定四株金针菇线粒体序列差异, 分子植物育种(网络版), 19(20): 1-6 (doi: 10.5376/mpb.cn.2021.19.0020) (L俟X.M., Wang X.F., Zhang D.W., Wang Q.J., and Wang W., 2021, Distinction identification among four Flammulina velutipes mitochondrial sequences based on whole genome resequencing, Fengzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 19(20): 1-6 (doi: 10.5376/mpb.cn.2021.19.0020))
摘 要

在真核细胞中,线粒体是氧化磷酸化的发生部位。它广泛存在于生物体中,具有独立的遗传物质DNA,能够参与细胞质遗传。目前金针菇线粒体基因组已经被解析,但其在不同菌株中的多态性仍未见报道。本研究结合已经公布的金针菇菌株4019-20线粒体基因组,组装和注释了重测序的3株金针菇(6-3, 6-21, L22)线粒体序列。基因组比较分析表明:金针菇线粒体基因组长度在87 646~88 508 bp之间,编码蛋白数量均为15个,编码tRNA数目为26个,编码rRNA大亚基和小亚基的基因各1个。除4019-20菌株含有9个内含子外,其余菌株均含有10个内含子。进一步对四株金针菇线粒体基因组结构共线性分析,结果表明:在4个菌株中含有4个差异片段,其中差异片段I为cox1基因第4内含子(菌株4019-20缺失)。同时,我们还检测到金针菇线粒体基因组中有两个片段存在移位现象,在移位位点处存在~1.6 kbp和~2.8 kbp的多态性片段。本研究结果能为金针菇线粒体基因组结构和遗传特性研究提供一定数据基础。

关键词
金针菇;线粒体;差异片段;基因组结构
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《分子植物育种》网络版
• 第 19 卷
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