研究报告/Research Report

生物信息学鉴定分析茄子脂肪酸去饱和酶(FAD)基因家族  

朱宗文 , 张爱冬 , 吴雪霞 , 查丁石
上海市农业科学院园艺研究所/上海市设施园艺技术重点实验室, 上海, 201106
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2021 年, 第 19卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2021年05月12日    接受日期: 2021年05月12日    发表日期: 2021年05月19日
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本文首次发表在 《分子植物育种》(ISSN1672-416X,CN46-1068/S)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

朱宗文, 张爱冬, 吴雪霞, 查丁石, 2021, 生物信息学鉴定分析茄子脂肪酸去饱和酶(FAD)基因家族, 分子植物育种 (网络版) 19(21): 1-11 (doi: 10.5376/mpb.cn.2021.19.0021) (Zhu Z.W., Zhang A.D., Wu X.X., and Zha D.S., 2021, Identification and Bioinformatics Analysis of Fatty Acid Desaturase (FAD) Gene Family in Eggplant (Solanum melongena L.)., Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding (online)), 19(21): 1-11 (doi: 10.5376/mpb.cn.2021.19.0021))

摘 要

脂肪酸去饱和酶(FAD)广泛分布于生物体内,其主要功能是在脂肪酸的生物合成过程中,从碳链中去除氢,从而产生碳碳双键。利用拟南芥FAD家族基因和茄子基因组数据,对茄子基因中可能含有的FAD基因进行鉴定和生物信息学分析。共鉴定出茄子FAD基因家族成员38个,其中FAB亚家族成员5个。对家族成员进行蛋白理化性质分析、系统进化分析和保守结构域分析,发现各亚家族成员间具有较为相似的保守基因序列和蛋白特性;基因结构分析表明,FAD家族成员间存在着不同的基因结构,但聚为一类的亚家族基因具有进化的保守性;染色体定位显示茄子FAD家族成员主要分布在5号染色体、6号染色体和4号染色体上。亚细胞定位预测茄子FAD家族成员主要分布在内质网、叶绿体和质膜上,FAB亚家族则全部定位在叶绿体上。

关键词
脂肪酸去饱和酶(FAD);茄子(Solanum melongena L.);基因家族
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    0.625
00120
《分子植物育种》网络版
• 第 19 卷
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