SRAP和RGA标记技术在甘薯的抗茎线虫病遗传多样性中的应用  

黄文静 , 王钰 , 蒋琳 , 季必霞 , 陈达伟
安徽大学资源与环境工程学院, 安徽大学生命科学学院, 安徽省生态工程与生物技术重点实验室, 合肥, 230039
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 46 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0046
收稿日期: 2010年12月22日    接受日期: 2011年04月07日    发表日期: 2011年04月15日
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黄文静等, 2011, SRAP和RGA标记技术在甘薯的抗茎线虫病遗传多样性中的应用, 分子植物育种 Vol.9 No.46 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0046)

摘 要

为了评价甘薯种质的抗茎线虫病遗传多样性,选用SRAP和RGA分子标记方法,SRAP和RGA引物设计如下:利用Blast软件,对Genbank数据库中由王钰等克隆的342个甘薯RGA(编号为DQ903322-DQ903664)与抗线虫病基因(RGC1、RX)进行比对,筛选出与抗病基因同源性高于50%的RGA序列11个,以高抗甘薯茎线虫病品种徐78-1和感茎线虫病品种徐薯18的基因组DNA为亲本,基因组DNA采用改良的CTAB法提取得到,然后将没有多态性的RGA结合SRAP组合成SRAP-RGA引物,筛选出五对有多态性的SRAP-RGA引物。将SRAP和RGA技术结合起来研究50个甘薯品种的抗茎线虫病遗传多样性。结果显示,5对引物组合经过PCR扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测共产生57条带,平均每对引物组合产生9~13条带,其中多态性条带49条,占总条带数的85.96%。其中多态率最高的引物对是EM4-S2-A07-F,为100%。最低的引物对是EM8-S1-F03-F,为63.6%。根据SRAP-RGA标记结果,应用UPGMA法,采用NTSYS-pc软件对50个甘薯种质进行聚类分析,它们之间的相似系数范围在0.2~0.8之间。UPGMA聚类分析显示,在相似系数为0.58处50份甘薯品种被划分为3大类群。这说明SRAP和RGA标记技术可有效用于甘薯的抗病遗传多样性研究,并为杂交亲本的选择提供理论依据。

关键词
甘薯;SRAP;RGA;聚类分析;遗传多样性
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