大白菜单一基因微卫星标记的电子遗传图谱  

梁翠1 , 王哲1 , 倪梦2 , 黎瑞源2 , 孟金陵2 , 朴钟云1
1.沈阳农业大学园艺学院,沈阳,1108662
2.华中农业大学作物遗传改良国家重点实验,武汉,430070
1.沈阳农业大学园艺学院,沈阳,1108662
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作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 59 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0059
收稿日期: 2011年01月10日    接受日期: 2011年04月18日    发表日期: 2011年05月16日
© 2011 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
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梁翠等, 2011, 大白菜单一基因微卫星标记的电子遗传图谱, 分子植物育种 Vol.9 No.59 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0059)

摘 要

本研究以大白菜(Brassica rapa ssp pekinensis)182 703条表达序列标签(EST)为序列来源,在分析微卫星在大白菜基因组中分布的基础上,利用单一基因微卫星(unigene derived microsatellite, UGMS)标记构建了电子遗传图谱。结果表明,在利用182 703条EST拼接成的38 753个单一基因中,4 881个含有5 537个微卫星,占总数的12.6%。定位于10个连锁群的338个大白菜细菌人工染色体(Bacterial Artificial Chromosome, BAC)克隆共包含2 252个UGMS标记。平均每个BAC克隆包含6.7个UGMS。这些UGMS标记定位在由10个连锁群构成的电子遗传图谱中,总长度为1 170.1 cM。每个连锁群中分布有107-485个UGMS标记。在2 252个UGMS标记中,837个在连锁群中具有单一位点,756个有两个位点,其余的有3个或3个以上位点。这些多位点UGMS标记位于同一条连锁群或不同连锁群中。

关键词
大白菜;单一基因;单一基因微卫星标记;电子遗传图谱
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