张颖 , 樊秀彩 , 姜建福 , 孙海生 , 李民 , 张永辉 , 刘崇怀

中国农业科学院郑州果树研究所, 郑州, 450009
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 94 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0094
收稿日期: 2011年06月20日    接受日期: 2011年07月21日    发表日期: 2011年07月25日

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推荐引用：

引用格式(中文)：
 张颖等, 2011, 几种果树及拟南芥开花基因LFY密码子偏好性分析, 分子植物育种(online) Vol.9 No.94 pp.1673-1679 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011. 09.0094)
引用格式(英文)：
 Zhang et al., 2011, Characterization of Codon Usage of LFY Genes in Several Fruit Trees, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.9 No.94 pp. 1673-1679 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0094)

由于不同物种在密码子的使用上存在不同的偏性，而密码子偏性与核酸遗传信息和生物功能载体蛋白质相关联，具有重要的生物学意义。本研究运用相关生物学软件和数理统计学软件对甜橙、桃、葡萄、芒果、甜杏、苹果、砂梨LFY (terminal flower)基因的密码子用法进行了分析，并与模式植物拟南芥的LFY基因进行了比较。结果表明，几种果树间的LFY基因密码子偏性差异不大，都偏好使用CG结尾的密码子，而拟南芥密码子第三位碱基的分布较均匀。不同物种的LFY基因在密码子上的差异与其亲缘关系呈正相关，表现为亲缘关系越近的物种其基因密码子的用法越相似。基于密码子用法的偏好研究结果可以作为物种进化关系和分子机理研究的重要补充。

LFY基因；密码子偏性；果树