孙小艳¹ , 李彦强¹ , 江聪² , 徐立安² , 余发新¹

1江西省科学院, 南昌, 330029
2南京林业大学林木遗传与生物技术重点实验室, 南京...
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 98 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0098
收稿日期: 2011年06月20日    接受日期: 2011年08月21日    发表日期: 2011年08月22日

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推荐引用：

引用格式(中文)：
       孙小艳等, 2011, 杂种马褂木EST-SSR引物开发及多态性分析, 分子植物育种(online) Vol.9 No.98 pp.1706-1710 (doi: 10.5376/mpb.cn. 2011.09.0098)
引用格式(英文)：
       Sun et al., 2011, Development and Characterization of Microsatellite Markers from Expressed Sequence ags for Liriodendron chinese×Liriodendron tulpifera, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.9 No.98 pp. 1706-1710 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0098)

为了加速分子标记在杂种马褂木研究中的应用，利用本实验室构建的杂种马褂木不定根均一化cDNA文库获得的2 921条非冗余ESTs序列进行EST-SSR标记的开发，在166条ESTs中发现了181个EST-SSR，占全部ESTs的5.683%，杂种马褂木EST-SSR平均长度为25.22 bp。EST-SSR的分布频率和特征分析表明，二核苷酸和三核苷酸重复基序的SSRs数量最多，占总数的91.16%。在二核苷酸重复类型的EST-SSRs中，含GA/TC基序的数量最多，共103个，占二核苷酸重复基序的98.095%；在60个三核苷酸重复类型的EST-SSRs中，AAG/CTT基序出现频率最高，共27个，占三核苷酸重复基序数的45%。利用SSR-ESTs序列共设计152对EST-SSR引物，选用中国马褂木、北美鹅掌楸及选育的优良杂种马褂木品种进行多态性研究。其中115对在鹅掌楸上有扩增产物，61对扩增出多态，多态性引物占所设计引物的40.10%。本研究证实杂种马褂木基因组中含有大量SSR，利用EST序列开发的SSR标记将在杂种马褂木遗传多样性分析、遗传图谱构建以及比较基因组等研究方面具有广阔的利用前景。

杂种马褂木；EST-SSR；标记；多态性