冷杉基因组DNA遗传标记芯片的构建与分析  

饶龙兵
中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 富阳, 311400
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 101 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0101
收稿日期: 2011年08月14日    接受日期: 2011年09月07日    发表日期: 2011年09月15日
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推荐引用:

引用格式(中文):
     饶龙兵, 2011, 冷杉基因组DNA遗传标记芯片的构建与分析, 分子植物育种(online) Vol.9 No.101 pp.1647-1653 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0101)
引用格式(英文):
     Rao, 2011, Creating andAnalyzing of Biochip of Genetic Markers on Genomic DNA of Abies, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.9 No.101 pp.1647-1653 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0101)

摘 要

分子遗传标记技术正在从以测量DNA片段大小的凝胶电泳技术向以杂交为基础的高通量芯片技术过渡。本文主要研究了冷杉基因组DNA提取方法、基因组DNA的复杂性和复杂性降低方法、芯片的文库构建、芯片质量控制和有效标记参数选取、基因组DNA遗传标记芯片的制作方法,并将冷杉基因组DNA遗传标记芯片在冷杉遗传多样性检测中做了初步应用。研究结果表明:用改良的CTAB法提取冷杉基因组DNA质量较好,满足生物芯片对DNA质量要求;利用PstⅠ+TaqⅠ+MseⅠ酶切组合和PstⅠ引物扩增得到克隆片段数量与质量均较好;试验共挑选4 608克隆点(标记点)制作芯片,得到821个有效标记点,得率约17.8% ;用该芯片试分析8个供试样品遗传多样性水平,结果显示8个样品多态位点百分率为100%,多态信息指数为0.40,利用得到的标记位点可以有效开展8个样品的遗传关系分析,样品遗传距离位置和大小在重复样品中支持率为100%,表明结果可靠。本试验将生物芯片技术和遗传标记技术结合起来,成功制作了能用于遗传分类和遗传多样性检测的冷杉基因组DNA遗传标记芯片,该技术还可以广泛应用于遗传作图、分子辅助育种、物种分类和进化等研究。

关键词
冷杉;基因组DNA;遗传多样性;遗传标记芯片技术
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