砂梨MYB基因启动子克隆、生物信息学预测与等位变异分析  

王月志1 , 戴美松1 , 张绍铃2 , 施泽彬1,2
1浙江省农业科学院园艺研究所, 杭州, 310021
2南京农业大学梨工程技术研究中心, 南京, 210095
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 110 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0110
收稿日期: 2011年08月16日    接受日期: 2011年09月28日    发表日期: 2011年10月20日
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推荐引用:

引用格式(中文):
王月志等, 2011, 砂梨MYB基因启动子克隆、生物信息学预测与等位变异分析, 分子植物育种(online) Vol.9 No.110 pp.1799-1806 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0110)

引用格式(英文):
Wang et al., 2011, Cloning, bioinformatics prediction and allelic analysis of the promoters of sand pear putative MYB gene, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.9 No.110 pp.1799-1806 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0110)

摘 要

应用同源克隆方法从砂梨(Pyrus pyrifolia)中获得4个长度分别为821 bp、874 bp、972 bp和914 bp木质素合成调控因子MYB基因的启动子序列,GenBank登录号分别为JF900710、JF900709、JF900707和JF900708。生物信息学预测发现,这些序列具有典型的启动子序列特征,分别包含71个、77个、86个和64个调控元件。所预测的调控元件按功能主要分为组织特异性、生物胁迫应答、非生物胁迫应答、胁迫激素应答、生长激素应答和基础调控元件。部分类型调控元件在不同启动子间存在明显的数量差异。各启动子序列在褐、绿果皮砂梨间的等位变异分析发现,PpMYBx2启动子区的一个SNP(A/G)位点与砂梨果皮褐、绿色性状间存在相关性。本研究为进一步开展MYB基因的表达分析、遗传定位,以及探明砂梨木质素相关品质性状形成的分子机制奠定了基础。

关键词
砂梨;木质素;MYB启动子; 等位变异
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