广东割手密SSR遗传多样性分析  

樊丽娜 , 李昱 , 罗青文 , 劳方业 , 王勤南 , 何慧怡 , 陈月桂 , 邓海华 , 李奇伟 , 齐永文
广州甘蔗糖业研究所, 广东省甘蔗改良与生物炼制重点实验室, 广州, 510316
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 46 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0046
收稿日期: 2012年05月28日    接受日期: 2012年06月01日    发表日期: 2012年09月27日
© 2012 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次发表在 《分子植物育种》(2012年第10卷第5期613-619页)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):
樊丽娜等, 2012, 广东割手密SSR遗传多样性分析, 分子植物育种(online) Vol.10 No.46 pp.1338-1345 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0046)
引用格式(英文):
Fan et al., 2012, Gentic Diversity of Saccharum spontaneum L. from Guangdong Province Analyzed Based on SSR Markers, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.46 pp.1338-1345 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0046)

摘 要

割手密是甘蔗近缘野生种之一,在甘蔗育种中具有重要地位和作用。本研究采用Genomic-SSR和EST-SSR两种类型分子标记对来自广东各个地区的67个割手密种质进行分析。在20对SSR引物上共检测到341个多态性条带,每个引物上的平均多态性为17.05,其中11个Genomic-SSR的平均多态性为20.82,9个EST-SSR的平均多态性为12.44。广东割手密在Genomic-SSR上的多态性显著高于EST-SSR上的多态性。Mantel Test 分析表明:通过Genomic-SSR、EST-SSR以及Genomic-SSR+EST-SSR三种方法所计算的试验材料的遗传距离矩阵之间都呈极显著相关(p<0.01),说明应用两种类型SSR获得的各个材料间的遗传关系具有较高的一致性。广东割手密在20对SSR引物上的遗传多样性指数介于0.106 4~0.291 6之间,平均多样性指数为0.194 3;各个材料间的遗传距离为0.006 3~0.308 2之间,平均为0.193 5。UPGMA聚类分析表明:广东割手密之间的遗传关系和地理来源存在一定的相关,由南向北存在较为显著的地理分化。

关键词
广东;割手密;SSR;遗传多样性
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《分子植物育种》网络版
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