洋葱种质资源遗传多样性的SSR分析  

关绚丽1,2 , 田保华1,3 , 梁毅1 , 王永勤1
1.山西农业大学园艺学院, 山西晋中, 030801
2.北京市农林科学院蔬菜研究中心, 北京, 100097
3.山西大学生命科学学院, 太原, 030005
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 56 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0056
收稿日期: 2011年03月22日    接受日期: 2011年04月28日    发表日期: 2011年05月11日
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关绚丽等, 2011, 洋葱种质资源遗传多样性的SSR分析, 分子植物育种 Vol.9 No.56 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0056)

摘 要

应用SSR标记对63份洋葱种质资源遗传多样性进行了分析。从40个SSR引物中筛选出8对扩增条带清晰、可重复、多态性高的引物,在63份资源样品中共扩增出50条带,其中检测到27个等位变异,多态性条带比率(PPB)为54%,每对SSR引物检测到等位变异2-5个,平均3.125个。8对引物的多态性信息量(PIC)变化范围为0.2254-0.6987,多态性信息量(PIC),Shannon信息指数(I),Nei's基因多样性指数(H)平均分别为0.4973,0.9041,0.5200。SSR聚类分析表明,可以将63份洋葱品种分为2大类,其中短日照洋葱与部分中日照洋葱品种聚一大类,长日照与部分中日照洋葱品种聚一大类,表明了中日照类型洋葱起源分化的复杂性; 而在长日照类型中Yellow Globe  Danvers 耐贮性品种聚为一个类群,Spanish长日照类型品种聚为一个类群。较好的揭示了洋葱种质资源遗传多样性与种内亲缘关系,为遗传育种和选择杂交亲本提供科学依据。

关键词
洋葱;SSR;遗传多样性
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《分子植物育种》网络版
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