李宗飞^1,2,3,4 , 蔡梦蝶^1,2 , 刘振鹏¹ , 张洁^1,2 , 魏芳^1,2 , 方宣钧^1,2,3,4

1浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所, 诸暨, 311800;
2翠溪生物技术研究院, 诸暨, 311800;
3海南省热带农业资源开发利用研究所, 三亚, 572025;
4广西大学生命科学与技术学院, 南宁, 530005
作者    通讯作者
豆科基因组学与遗传学, 2017 年, 第 8卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2016年12月25日    接受日期: 2017年01月17日    发表日期: 2017年02月23日

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推荐引用：

Li et al., 2017, Identification of genes related to the key regulatory circuit of circadian clock in legume plant, Legume Genomics and Genetics, 08(1): 1-9 (doi: 10.5376/lgg.2017.08.0001)
 

为了揭示生物钟调控网络机制在豆科的3个物种(蒺藜苜蓿, 百脉根和大豆)中的演变规律。本研究通过Geneontology (GO)查找拟南芥生物钟的调控因子，同时根据相关的文献进行补充和佐证。然后将得到的调控因子在全基因组水平上与蒺藜苜蓿，百脉根和大豆这三个物种进行比对，进行相应的直系同源基因的鉴定、保守结构功能域的分析、多序列联配、系统进化树构建和进化分析以及基因的重新注释。本研究一共鉴定了108个大豆的生物钟相关候选基因，51个百脉根的生物钟相关候选基因，34个蒺藜苜蓿的生物钟相关候选基因。我们从鉴定的直系同源基因的候选基因中选取LHY/CCA1、PRR和CHE基因构建了3个分子进化树，分析表明，生物钟调控途径在拟南芥和豆科的这3个物种中发生了不同程度的分化，尤其是在一些关键性的成分比如生物钟调控的核心成分以及控制花期的关键性基因上。对以后研究豆科的生物钟调控网络在实验阶段时的研究有一定的指导和参考价值。

豆科；生物钟；调控；基因；鉴定