赵姝君¹ , 王敬姣¹ , 王梦楠 ¹ , 吴茜红¹ , 李冬杰² , 李世杰¹

1 河北农业大学 生命科学学院, 保定, 071001;
2 河北科技大学 生物科学与工程学院, 石家庄, 050018
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2014 年, 第 3卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2014年08月13日    接受日期: 2014年08月26日    发表日期: 2014年09月28日

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推荐引用：

Zhao S.J., Wang J.J., Wang M.N., Wu X.H., Li D.J., and Li S.J., 2014, Tissue expression and bioinformatics analysis of Bovine Phlda2 Gene, Jiyin Zuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 33(3): 505-510 (赵姝君, 王敬姣, 王梦楠, 吴茜红, 李冬杰, 李世杰, 2014, 牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 33(3): 505-510)

在人、鼠和猪中，Phlda2基因是一个母源表达的印记基因，编码一种胞浆蛋白，具有与血小板同源的结构域。在牛中，Phlda2基因的结构和功能还不清楚。本研究首先利用 RT-PCR 方法对Phlda2基因在牛组织中的表达进行了分析，进而采用生物信息学方法对牛Phlda2基因的分子进化、启动子及蛋白的高级结构进行了分析和预测。结果表明，Phlda2基因在牛的心、肝、脾、肺、肾、大脑、骨骼肌、皮下脂肪、卵巢和胎盘10个组织中均有表达。对包括人、小鼠、牛、猪、原鸡、非洲爪蝉、斑马鱼和袋鼠在内的8种动物Phlda2基因mRNA序列进化进行分析，发现这8种动物的遗传距离小于0.435，且牛和猪遗传距离最近，为0.148，与基因系统进化树分析的结果一致。牛Phlda2基因的启动子最可能位于该基因起始密码子上游487~737 bp区域，包括20种转录因子结合位点。牛Phlda2基因编码亲水性蛋白，其二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主；蛋白三级结构包括一个由β片层和α-螺旋构成的血小板同源结构域(PH)。以上研究结果将为进一步研究 Phlda2基因的功能和分析基因表达调控的分子机理奠定基础。

牛；Phlda2 基因；生物信息学；组织表达