树鼩是灵长类总目中树鼩目的一种较为原始的小型哺乳动物，生长在东南亚、南亚热带地区。树鼩目中有2科：树鼩科和笔尾树鼩科；5个属：南印树鼩属、细尾树鼩属、树鼩属、菲律宾树鼩属及笔尾树鼩属，共20个种，其中树鼩属(Tupaia)有15个种，为最大的一个属(Young, 2011)。随着北方树鼩的全基因组测序的完成，树鼩的系统分类地位得到了分子遗传学水平上的证实(Fan et al., 2013; Young, 2013)。

1树鼩染色体信息
树鼩目中的大多数种的染色体组型为2n=52~68，只有菲律宾树鼩(Urogaleeveretti)的染色体组型为2n=44 (Chu and Bender, 1962)。已有的研究表明：巴拉望树鼩(Tupaiapalawanensis)的2n=52 (Arrighi et al., 1969; Bender and Chu, 1964)；普通树鼩(Tupaiaglis)和长脚树鼩(Tupaialongipes)的2n=60 (Arrighi et al., 1969; Hsu and Johnson, 1963; Bender and Chu, 1964)；北方树鼩之中国亚种(Tupaiabelangerichinensis)，越北亚种(Tupaiabelangeritonquinia)和瑶山亚种(Tupaiabelangeriyaoshanensis)的染色体数目均为2n=62 (刘瑞清等, 1989)；倭树鼩(Tupaia minor)的2n=66 (Arrighi et al., 1969)；山树鼩(Tupaiamontana)的2n=68 (Arrighi et al., 1969; Lisco et al., 1973)。

2中国树鼩基因组概况
最新的树鼩全基因组测序数据于2013年2月5日在线发表在国际著名学术期刊《Nature Communications》上，论文题目为《Genome of the Chinese Tree Shrew》。Yao和他的研究组利用一只来自中国云南昆明的雄性北方树鼩(Tupaiabelangerichinensis)测序了其全基因组，总覆盖度高达79x，获得了一个基因组大小为2.86 GB的参考基因组(表1)，接近由K-mer计算估算的3.2 GB的基因组大小。树鼩基因组大约含有22,063蛋白编码基因，接近人类基因数量；在基因组中含有35%的重复元件以及14%的重要的转座子。

表1 中国树鼩基因组的总体统计(摘自：Fan et al., 2013) Table 1 Global statistics of the Chinese tree shrew genome (Adopted from Fan et al., 2013)

3树鼩重要功能基因
树鼩基因组大约含有22 063蛋白编码基因。树鼩基因组中的一些基因家族发生了扩张(图1)，例如免疫球蛋白λ轻链(IGLV)基因家族等；出现了一些假基因和基因丢失现象，比如前列腺特异性转谷氨酰酶4基因(TGM4)；树鼩基因组中缺失DDX58基因，该基因功能的缺失，表明免疫反应的中断可能在造成丙肝感染中具有重要作用；一些重要功能基因出现了提前终止或者移码突变以致基因功能丧失，如细胞防御酸刺激的NOX1基因的假基因化。

图1 树鼩IGLV基因家族的特异扩张(摘自: Fan et al., 2013) Figure 1 Specific expansion of the immunoglobulin lambda variable (IGLV) gene family in tree shrews (Adopted from Fan et al., 2013)

TRIM5，一种宿主限制性因子，在树鼩基因组中存在5个串联重复拷贝(图2)，其中一个具有CypA逆转录转座插入，形成了TrimCyp嵌合转录体，这种现象仅发生在少数灵长类中，在限制逆转录病毒活性中具有重要意义(Fan et al., 2013)。

图2 树鼩与人类的TRIM基因簇(摘自: Fan et al., 2013) Figure 2 Trim gene cluster in tree shrew and human (Adopted from Fan et al., 2013)

树鼩基因组中鉴定出28个树鼩与灵长类共有的功能性基因，之前的研究认为这些基因是灵长类所特有的(Fan et al., 2013)；树鼩基因组中包含209个与人类相同的视觉相关基因，但是相比于人类，却缺少了两种中波长视蛋白基因，说明树鼩其与低等灵长类一样，是二元色视觉动物(Fan et al., 2013)。

树鼩基因组中鉴定出23个已知的神经递质转运蛋白(Fan et al., 2013)，这些神经递质转运蛋白是抗抑郁药物的重要靶点，可以通过抑制其活性实现对抑郁病患者的治疗。

细胞色素P450超家族能够编码一些与药物代谢、活化和相互作用相关的一些酶。树鼩拥有与人类非常接近的细胞色素P450超家族的组成结构和基因一致性(Fan et al., 2013)。这种在人和树鼩中的药物靶点以及相关信号通路的保守性，使得树鼩更好的用于评价用于药物分布、药物靶点、药代动力学以及药物副作用研究。

参考文献
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