2 仲恺农业工程学院生命科学学院, 广州 510225;
3广东省农科院科技情报研究所, 广州, 510640
作者 通讯作者
植物药与药理学杂志, 2012 年, 第 1卷, 第 2 篇
收稿日期: 2012年10月05日 接受日期: 2012年10月16日 发表日期: 2012年10月28日
引用格式(中文):
林春华等, 2012, SRAP分子标记分析体系的建立及白簕资源亲缘关系分析, 基因组学与应用生物学, 31(5): 498-504 (doi: 10.3969/gab.031.000498)
引用格式(英文):
Lin et al., 2012, Optimization of SRAP-PCR System for Phylogenetic Analysis of Acanthopanax trifoliatus Species, Genomics and Applied Biology, 31(5): 498-504(doi: 10.3969/gab.031.000498)
本实验对影响SRAP-PCR体系中的Mg2+、dNTPs和引物浓度等因子进行了体系优化,建立了一套适合白簕SRAP检测的25μl反应体系:1.5 mmol/l Mg2+,1.5 mmol/L dNTPs,1 µmol/L引物,10 ng模板DNA,1.5 U Taq DNA聚合酶;进一步以白梗簕菜为模板,利用优化的体系进行多态性标记引物组合分析,共筛选出17对引物;利用这些引物对7个白簕品种进行SRAP遗传多样性分析,共扩增出461条谱带。其中多态性谱带155条,多态性谱带比率为33.6%,白簕品种间的相似系数为0.7077~0.9474。经UPGMA聚类分析结果显示,所检测的7个白簕品种分为二大类,其中亲缘关系较近的青梗簕菜和细叶密刺簕菜聚成了一组;而其余的四个种,包括白梗簕菜、细叶小刺簕菜、紫柄簕菜、大叶大刺簕菜和红梗簕菜,聚成另一组。