同济大学生命科学与技术学院, 上海, 20082
作者 通讯作者
医学遗传学与疾病研究, 2020 年, 第 9卷, 第 1 篇
收稿日期: 2020年05月03日 接受日期: 2020年05月05日 发表日期: 2020年05月05日
作者 通讯作者
医学遗传学与疾病研究, 2020 年, 第 9卷, 第 1 篇
收稿日期: 2020年05月03日 接受日期: 2020年05月05日 发表日期: 2020年05月05日
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推荐引用:
引用格式(中文):
魏志洁, 陈鑫, 2020, 结直肠癌相关lncRNA的功能分析及鉴定, 医学遗传学与疾病研究(online) Vol.9 No.1 pp.1-8 (doi: 10.5376/mgdr.cn.2020.9.0001)
引用格式(英文):
Wei Z.J., and Chen X., 2020, The Function Analysis and Identification of lncRNA Associated with Colorectal Cancer, Yixue Yichuanxue Yu Jibing Yanjiu (online) Vol.9 No.1 pp.1-8 (doi: 10.5376/mgdr.cn.2020.9.0001)
摘 要
为进一步了解结直肠癌(CRC)的发病机制和基因表达层面上的特点,本研究采用了来自GEO平台的RNA-seq数据,探究结直肠癌相关的mRNA及lncRNA的生物学功能,并且利用已有注释信息和相关软件,对潜在的lncRNA做出预测。通过比较健康样本和患病样本的数据,对mRNA及lncRNA进行差异表达分析,探究它们的功能,及其与结直肠癌的关系。本研究共识别出差异表达的基因1 032个,其中差异表达的lncRNA有164个;对所有差异基因做进一步的GO和KEGG分析,发现它们富集在与结直肠癌有密切关系的通路中。同时,本研究预测出219个新型lncRNA,可能与结直肠癌有密切的关系。上述研究结果进一步了解了结直肠癌中的lncRNA的活动情况,为该疾病的诊断和治疗提供参考。
关键词
结直肠癌;差异表达分析;预测新lncRNA
(The advance publishing of the abstract of this manuscript does not mean final published, the end result whether or not published will depend on the comments of peer reviewers and decision of our editorial board.)
(The advance publishing of the abstract of this manuscript does not mean final published, the end result whether or not published will depend on the comments of peer reviewers and decision of our editorial board.)