张强 , 张晓伟 , 孟月娥 , 李艳敏 , 王慧娟 , 王利民

河南省农业科学院园艺研究所, 郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 14 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0014
收稿日期: 2010年08月11日    接受日期: 2010年10月21日    发表日期: 2011年02月22日

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推荐引用：

张强等, 2011, 玳玳花咖啡酸甲基转移酶基因的电子克隆及序列分析, 分子植物育种 Vol.9 No.14 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0014) 

许多植物的次生代谢化合物的合成涉及到一个或多个羟基由甲基转移酶(O-methyltransferases, OMTs)催化的的甲基化反应。本研究根据植物OMTs的保守结构域设计了1对简并引物，利用同源克隆的方法从香花植物玳玳花的花蕾中获得的一个OMT片段。随后，通过电子克隆的方法对NCBI的EST数据库进行搜索和比对获得了其cDNA序列全长，并经过RT-PCR验证。其推断的最大ORF框为1 101 bp，编码蛋白由366个氨基酸组成，分子量为39.9 kD，等电点为5.76。序列分析发现从第35个到第86个氨基酸为蛋白二聚化(Dimerisation)结构域，在许多植物甲基转移酶基因的N端存在，从第104个到第341个氨基酸为甲基转移酶结构域。同源比对和分子进化树分析发现，所获得的玳玳花OMT基因与植物COMTs (caffeic acid O-methyltransferases)具有较高的相似性而被命名为CaCOMT (GenBank登录号: HM641694)。最后，对CaCOMT的功能进行了讨论，其可能同时在木质素生物合成和花香物质代谢中起作用。

玳玳花；COMT；电子克隆；序列分析