何建文¹ , 杨文鹏^2,3 , 姜虹¹ , 韩世玉¹ , 杨红¹

1.贵州省辣椒研究所, 遵义, 563006
2.贵州省旱粮研究所, 贵阳, 550006
3.贵州省农业生物技术重点实验室, 贵阳, 550006
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2011 年, 第 9卷, 第 30 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0030
收稿日期: 2010年11月08日    接受日期: 2011年01月28日    发表日期: 2011年03月18日

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推荐引用：

何建文等, 2011, 48个辣椒地方品种SSR和SRAP标记的遗传多样性和指纹分析, 分子植物育种 Vol.9 No.30 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0030)

为了评估辣椒地方法种质资源的遗传多样性和保护其知识产权，本研究以48个辣椒地方品种为试材，采用SSR和SRAP标记技术，进行分子标记多态性和聚类分析并构建数字化指纹图谱。结果如下：1、遵义朝天椒和J1羊角型椒两品种间，75个SSR标记中有15个SSR位点具有多态性；SRAP标记的30对PCR引物组合中，有11对引物组合的PCR扩增位点具有多态性。在48个品种中，15个SSR标记平均可检测2.7个等位基因，平均多态信息量(PIC)为0.54；11个SRAP标记(对应于SRAP的11对PCR引物组合)平均可检测16个等位基因，平均PIC为0.85。可见，所研究的地方品种具有较丰富的遗传多样性。2、经聚类分析，48个品种基于SSR标记可被分为6类，基于SRAP标记可被分为7类，基于SSR+SRAP标记可被分为5类。分类结果与果实形状有一定的关联，而且基于SSR+SRAP标记的分类更切合实际。3、构建的48个品种15个SSR标记和11个SRAP标记的数字化指纹图谱，出现完全相同指纹的概率非常低，可用于知识产权保护和品种鉴定。经用聚类分析筛选，只需选择CA514272、Hpms2-21、 Hpms1-69、 CA516439、 Hpms1-139和 BM61910等6个SSR标记，或者me1+em7和me2+em8两个SRAP标记即可鉴定参试品种。研究结果对于辣椒种质资源的遗传改良、育种实践、知识产权保护和品种鉴定具有实际意义。

辣椒； SSR；SRAP；遗传多样性；指纹图谱