高东¹ , 毛如志¹ , 魏富刚² , 何霞红¹

1 云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程中心, 教育部农作物多样性与病害控制重点实验室, 植物...
作者    通讯作者
《分子植物育种》网络版, 2012 年, 第 10卷, 第 23 篇   doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0023
收稿日期: 2012年04月20日    接受日期: 2012年04月26日    发表日期: 2012年05月23日

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推荐引用：

引用格式(中文)：
高东等, 2012, 地方稻月亮谷花期控制基因Hd3a、Hd1、Edh1和Ghd7的多态性分析, 分子植物育种(online) Vol.10 No.23 pp.1164-1170 (doi: 10.5376/mpb. cn.2012.10.0023)
引用格式(英文)：
Gao et al., 2012, Analysis of Functional Nucleotide Polymorphisms in Hd3a, Hd1, Edh1 and Ghd7 Genes Controlling Heading Date in Yuelianggu Landrace, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.23 pp.1164-1170 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0023)

水稻抽穗期控制的关键基因已基本清楚，但是栽培稻花期多样性的分子机理仍然不清楚。本文利用重测序月亮谷的全基因组序列、Takahashi等(2009)在PNAS上发表的部分数据和Xue等(2008)在Nature genetics发表的部分数据，研究了Hd3a、Hd1、Edh1和Ghd7等4个基因的核苷酸多态性。结果显示，月亮谷Hd3a启动子区核苷酸多态性分布与前人报道的有所不同，发现5个特有的SNP位点，分别位于-1 851 bp、-1 720 bp、-700 bp、-681 bp和-1 607 bp处；1个特有的InDel，位于-523 bp处。月亮谷Hd1编码区其具有很高的多态性，发现6个特有的SNP/InDel位点，其中包括了所有4个移码位点，1个插入位点和1个缺失位点，月亮谷Hd1属无功能的等位基因类型。月亮谷Ehd1编码区SNP/InDel与前人研究结果相似。月亮谷Ghd7属于前人报道的有功能的等位基因Ghd7-1。月亮谷抽穗期相关基因复杂的多态性，一方面与其生长环境垂直海拔落差导致的“一山分四季，十里不同天”的复杂小生境有关，另一方面可能是其耐病、耐寒，适应性广的分子基础。

地方稻；基因；抽穗期；单核苷酸多态性；哈尼梯田