任永晶 , 宋婷婷 , 姜柳 , 许慧慧 , 才华

东北农业大学生命科学学院, 哈尔滨, 150030
作者    通讯作者
豆科基因组学与遗传学, 2016 年, 第 7卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2016年08月22日    接受日期: 2016年08月22日    发表日期: 2016年08月22日

本文首次发表在 《分子植物育种》2016年，第 14 卷，第2期上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

引用格式(中文):

任永晶, 宋婷婷, 姜柳, 许慧慧, 才华, 2016, 蒺藜苜蓿PEPC蛋白生物信息学分析及在碱胁迫中功能的预测, 分子植物育种, 14(2): 344-351

引用格式(英文):

Ren Y.J., Song T.T., Jiang L., Xu H.H., and Cai H., Bioinformatics analysis of PEPC proteins from Medicago truncatula and functional predictions under alkaline stress, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 14(2): 344-351

磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPC)是一种广泛存在于自然界中的代谢酶，在高等植物中参与光合作用的碳固定、生物合成前体的供应、pH的调控等多种生物学过程。本研究通过生物信息学方法，识别、筛选、获得蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)PEPC(MtPEPC)的氨基酸序列Medtr2g076670.2，并对与Medtr2g076670.2相似的25个豆科PEPC基因进行系统进化树分析。着重对4个MtPEPCs和6个GmPEPCs基因进行功能域分析、蛋白二级结构域预测及组织表达特异性分析，以推测蒺藜苜蓿PEPC基因的功能。结果表明，该10个基因分为两个Group分支，两个分支中存在不同的亚细胞定位信号，并且两个分支中大豆基因在地上和地下组织之间存在差异。通过蛋白相互作用的预测分析，PEPC蛋白可与苹果酸脱氢酶(Malate dehydrogenase, MDH)、丙酮酸激酶(Pyruvate kinase, PK)及2个未知蛋白存在相互作用；在碱胁迫下，GsPEPCs基因与苹果酸脱氢酶基因是“共表达”基因。可以推测，PEPC对碱胁迫的反应，可能是通过调节有机酸含量实现的。通过对MtPEPC蛋白和GmPEPC蛋白的生物信息学分析，获得了其相应的分子生物学特征，为PEPC蛋白在碱胁迫反应中的功能提供理论依据。

蒺藜苜蓿；大豆；PEPC；生物信息学；碱胁迫